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SemOntoMap:一种临床文本语义标注的混合方法。

SemOntoMap: A Hybrid Approach for Semantic Annotation of Clinical Texts.

机构信息

Sorbonne Université, Inserm, Université Sorbonne Paris-Nord, LIMICS, Paris, France.

Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.

出版信息

Stud Health Technol Inform. 2024 Aug 22;316:1839-1843. doi: 10.3233/SHTI240789.

DOI:10.3233/SHTI240789
PMID:39176849
Abstract

This study addresses the challenge of leveraging free-text descriptions in Electronic Health Records (EHR) for clinical research and healthcare improvement. Despite the potential of this data, its direct interpretation by computers is limited. Semantic annotation emerges as a method to make EHR free text machine-interpretable but struggles with specific domain ontologies and faces heightened difficulties in psychiatry. To tackle these challenges, this study proposes a system based on unsupervised learning techniques to extract entities and their relationships, aligning them with a domain ontology. The effectiveness of this system has been validated within PsyCARE project by analyzing 60 patient discharge summaries.

摘要

本研究旨在解决利用电子健康记录(EHR)中的自由文本描述进行临床研究和改善医疗保健的挑战。尽管这些数据具有很大的潜力,但计算机直接解释这些数据的能力有限。语义标注作为一种方法,可以使 EHR 中的自由文本能够被计算机理解,但它在特定的领域本体方面存在困难,在精神病学方面更是面临巨大的挑战。为了解决这些挑战,本研究提出了一个基于无监督学习技术的系统,用于提取实体及其关系,并将其与领域本体对齐。该系统在 PsyCARE 项目中通过分析 60 份患者出院总结得到了验证。

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