• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

MUT-7 外切核酸酶的活性和定位由一个古老的结构域介导。

MUT-7 exoribonuclease activity and localization are mediated by an ancient domain.

机构信息

Max Perutz Labs, Vienna Biocenter Campus (VBC), Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Vienna, Austria.

Department of Structural and Computational Biology, Max Perutz Labs, University of Vienna, Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Vienna, Austria.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2024 Aug 27;52(15):9076-9091. doi: 10.1093/nar/gkae610.

DOI:10.1093/nar/gkae610
PMID:39188014
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11347159/
Abstract

The MUT-7 family of 3'-5' exoribonucleases is evolutionarily conserved across the animal kingdom and plays essential roles in small RNA production in the germline. Most MUT-7 homologues carry a C-terminal domain of unknown function named MUT7-C appended to the exoribonuclease domain. Our analysis shows that the MUT7-C is evolutionary ancient, as a minimal version of the domain exists as an individual protein in prokaryotes. In animals, MUT7-C has acquired an insertion that diverged during evolution, expanding its functions. Caenorhabditis elegans MUT-7 contains a specific insertion within MUT7-C, which allows binding to MUT-8 and, consequently, MUT-7 recruitment to germ granules. In addition, in C. elegans and human MUT-7, the MUT7-C domain contributes to RNA binding and is thereby crucial for ribonuclease activity. This RNA-binding function most likely represents the ancestral function of the MUT7-C domain. Overall, this study sheds light on MUT7-C and assigns two functions to this previously uncharacterized domain.

摘要

MUT-7 家族的 3'-5' 外切核糖核酸酶在动物界中是进化保守的,在生殖系中小 RNA 的产生中发挥着重要作用。大多数 MUT-7 同源物带有一个未知功能的 C 端结构域,命名为 MUT7-C,附加在外切核糖核酸酶结构域上。我们的分析表明,MUT7-C 是古老的进化产物,因为在原核生物中存在一个作为单个蛋白的最小版本的结构域。在动物中,MUT7-C 获得了一个在进化过程中分化的插入,扩展了其功能。秀丽隐杆线虫的 MUT-7 在 MUT7-C 内包含一个特定的插入,允许与 MUT-8 结合,从而使 MUT-7 招募到生殖粒。此外,在秀丽隐杆线虫和人类 MUT-7 中,MUT7-C 结构域有助于 RNA 结合,因此对核糖核酸酶活性至关重要。这种 RNA 结合功能很可能代表了 MUT7-C 结构域的原始功能。总的来说,这项研究揭示了 MUT7-C,并为这个以前未被描述的结构域赋予了两个功能。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/4fab1a3af56c/gkae610fig7.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/cd019fb538d0/gkae610figgra1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/cc3f5c3dbe6b/gkae610fig1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/d7478be8fa81/gkae610fig2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/6cbd34cc7e47/gkae610fig3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/8f6a17bfebf2/gkae610fig4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/420b8d912e7b/gkae610fig5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/267b2e1c4fb8/gkae610fig6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/4fab1a3af56c/gkae610fig7.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/cd019fb538d0/gkae610figgra1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/cc3f5c3dbe6b/gkae610fig1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/d7478be8fa81/gkae610fig2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/6cbd34cc7e47/gkae610fig3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/8f6a17bfebf2/gkae610fig4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/420b8d912e7b/gkae610fig5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/267b2e1c4fb8/gkae610fig6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d467/11347159/4fab1a3af56c/gkae610fig7.jpg

相似文献

1
MUT-7 exoribonuclease activity and localization are mediated by an ancient domain.MUT-7 外切核酸酶的活性和定位由一个古老的结构域介导。
Nucleic Acids Res. 2024 Aug 27;52(15):9076-9091. doi: 10.1093/nar/gkae610.
2
RDE-2 interacts with MUT-7 to mediate RNA interference in Caenorhabditis elegans.RDE-2与MUT-7相互作用,介导秀丽隐杆线虫中的RNA干扰。
Nucleic Acids Res. 2005 Jan 13;33(1):347-55. doi: 10.1093/nar/gki183. Print 2005.
3
A conserved siRNA-degrading RNase negatively regulates RNA interference in C. elegans.一种保守的降解小干扰RNA的核糖核酸酶对秀丽隐杆线虫中的RNA干扰起负调控作用。
Nature. 2004 Feb 12;427(6975):645-9. doi: 10.1038/nature02302.
4
mut-16 and other mutator class genes modulate 22G and 26G siRNA pathways in Caenorhabditis elegans.mut-16 和其他突变体类基因在秀丽隐杆线虫中调节 22G 和 26G siRNA 通路。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jan 25;108(4):1201-8. doi: 10.1073/pnas.1018695108. Epub 2011 Jan 18.
5
Caenorhabditis elegans ABCRNAi transporters interact genetically with rde-2 and mut-7.秀丽隐杆线虫ABCRNAi转运蛋白与rde-2和mut-7发生遗传相互作用。
Genetics. 2008 Feb;178(2):801-14. doi: 10.1534/genetics.107.081588. Epub 2008 Feb 1.
6
A regulatory cytoplasmic poly(A) polymerase in Caenorhabditis elegans.秀丽隐杆线虫中的一种调节性细胞质聚腺苷酸聚合酶。
Nature. 2002 Sep 19;419(6904):312-6. doi: 10.1038/nature01039.
7
PAXT-1 promotes XRN2 activity by stabilizing it through a conserved domain.PAXT-1 通过其保守结构域稳定 XRN2,从而促进其活性。
Mol Cell. 2014 Jan 23;53(2):351-60. doi: 10.1016/j.molcel.2014.01.001.
8
MUT-7 Provides Molecular Insight into the Werner Syndrome Exonuclease.MUT-7 提供了对 Werner 综合征外切核酸酶的分子见解。
Cells. 2021 Dec 8;10(12):3457. doi: 10.3390/cells10123457.
9
MUT-14 and SMUT-1 DEAD box RNA helicases have overlapping roles in germline RNAi and endogenous siRNA formation.MUT-14和SMUT-1解旋酶在生殖系RNA干扰和内源性小干扰RNA形成中发挥重叠作用。
Curr Biol. 2014 Apr 14;24(8):839-44. doi: 10.1016/j.cub.2014.02.060. Epub 2014 Mar 27.
10
Structural basis and function of XRN2 binding by XTB domains.XTB结构域与XRN2结合的结构基础及功能
Nat Struct Mol Biol. 2016 Feb;23(2):164-71. doi: 10.1038/nsmb.3155. Epub 2016 Jan 18.

引用本文的文献

1
The structure, folding kinetics, and dynamics of long poly(UG) RNA.长链聚(UG)RNA的结构、折叠动力学和动态变化
Nucleic Acids Res. 2025 Jul 19;53(14). doi: 10.1093/nar/gkaf685.
2
Viral RNA pUGylation Promotes Antiviral Immunity in .病毒RNA的聚泛素化促进……中的抗病毒免疫
bioRxiv. 2025 Jul 9:2025.07.09.663919. doi: 10.1101/2025.07.09.663919.

本文引用的文献

1
Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3.利用 AlphaFold 3 进行生物分子相互作用的精确结构预测。
Nature. 2024 Jun;630(8016):493-500. doi: 10.1038/s41586-024-07487-w. Epub 2024 May 8.
2
Fast and accurate protein structure search with Foldseek.使用 Foldseek 进行快速准确的蛋白质结构搜索。
Nat Biotechnol. 2024 Feb;42(2):243-246. doi: 10.1038/s41587-023-01773-0. Epub 2023 May 8.
3
DNMT1 inhibition by pUG-fold quadruplex RNA.pUG 折叠四链体 RNA 抑制 DNMT1。
RNA. 2023 Mar;29(3):346-360. doi: 10.1261/rna.079479.122. Epub 2022 Dec 27.
4
DALI shines a light on remote homologs: One hundred discoveries.DALI 揭示了远程同源物:一百项发现。
Protein Sci. 2023 Jan;32(1):e4519. doi: 10.1002/pro.4519.
5
An atypical RNA quadruplex marks RNAs as vectors for gene silencing.一种非典型的 RNA 四链体将 RNA 标记为基因沉默的载体。
Nat Struct Mol Biol. 2022 Nov;29(11):1113-1121. doi: 10.1038/s41594-022-00854-z. Epub 2022 Nov 9.
6
ModelCraft: an advanced automated model-building pipeline using Buccaneer.ModelCraft:一个使用 Buccaneer 的高级自动化模型构建流水线。
Acta Crystallogr D Struct Biol. 2022 Sep 1;78(Pt 9):1090-1098. doi: 10.1107/S2059798322007732. Epub 2022 Aug 25.
7
Search and sequence analysis tools services from EMBL-EBI in 2022.2022 年 EMBL-EBI 的搜索和序列分析工具服务。
Nucleic Acids Res. 2022 Jul 5;50(W1):W276-W279. doi: 10.1093/nar/gkac240.
8
piRNAs coordinate poly(UG) tailing to prevent aberrant and perpetual gene silencing.piRNAs 协调 poly(UG) 尾化,防止异常和持续的基因沉默。
Curr Biol. 2021 Oct 25;31(20):4473-4485.e3. doi: 10.1016/j.cub.2021.07.076. Epub 2021 Aug 23.
9
orthologs MUT-7/CeWRN-1 of Werner syndrome protein regulate neuronal plasticity.沃纳综合征蛋白的同源物 MUT-7/CeWRN-1 调节神经元可塑性。
Elife. 2021 Mar 1;10:e62449. doi: 10.7554/eLife.62449.
10
Structural studies of RNase M5 reveal two-metal-ion supported two-step dsRNA cleavage for 5S rRNA maturation.RNase M5 的结构研究揭示了双金属离子支持的两步 dsRNA 切割,用于 5S rRNA 的成熟。
RNA Biol. 2021 Nov;18(11):1996-2006. doi: 10.1080/15476286.2021.1885896. Epub 2021 Feb 23.