Suppr超能文献

脓毒性心肌病中性粒细胞相关枢纽基因的生物信息学分析及 ceRNA 网络构建。

Bioinformatics analysis of neutrophil-associated hub genes and ceRNA network construction in septic cardiomyopathy.

机构信息

Department of Urology, The First Affiliated Hospital of Jinzhou Medical University, Jinzhou, China.

Department of Pediatric, The First Affiliated Hospital of Jinzhou Medical University, Jinzhou, China.

出版信息

Aging (Albany NY). 2024 Aug 30;16(19):12833-12849. doi: 10.18632/aging.206092.

Abstract

Septic cardiomyopathy (SCM) is a critical sepsis complication characterized by reversible cardiac depression during early septic shock. Neutrophils, integral to innate immunity, can mediate organ damage when abnormal, but their specific role in sepsis-induced myocardial damage remains elusive. Our study focuses on elucidating the role of Neutrophil-Related Genes (NRGs) in SCM, finding early diagnosis and treatment biomarkers. We identified shared differentially expressed genes (DEGs) from datasets GSE79962 and GSE44363 and pinpointed hub DEGs using the cytoHubba plugin in Cytoscape software. The Neutrophil-Related Hub Gene (NRHG) MRC1 was identified via intersecting hub DEGs with NRGs from WGCNA. We validated MRC1's abnormal expression in SCM using our data and external datasets. Furthermore, a neutrophil-related ceRNA network (AC145207.5/ miR-23a-3p/MRC1) was constructed and validated. Our findings reveal MRC1 as a potential NRHG in SCM pathogenesis, offering insights into neutrophil-mediated mechanisms in SCM and providing a novel molecular target for early diagnosis and intervention in SCM.

摘要

脓毒症性心肌病(SCM)是一种严重的脓毒症并发症,其特征是在早期脓毒性休克期间出现可逆性心脏抑制。中性粒细胞是固有免疫的重要组成部分,当异常时可以介导器官损伤,但它们在脓毒症引起的心肌损伤中的具体作用仍不清楚。我们的研究重点是阐明中性粒细胞相关基因(NRGs)在 SCM 中的作用,寻找早期诊断和治疗的生物标志物。我们从数据集 GSE79962 和 GSE44363 中识别出共同的差异表达基因(DEGs),并使用 Cytoscape 软件中的 cytoHubba 插件确定了枢纽 DEGs。通过将枢纽 DEGs 与 WGCNA 中的 NRGs 进行交集,确定了中性粒细胞相关枢纽基因(NRHG)MRC1。我们使用我们的数据和外部数据集验证了 MRC1 在 SCM 中的异常表达。此外,构建并验证了一个与中性粒细胞相关的 ceRNA 网络(AC145207.5/miR-23a-3p/MRC1)。我们的研究结果表明 MRC1 是 SCM 发病机制中的一个潜在的 NRHG,为 SCM 中中性粒细胞介导的机制提供了深入了解,并为 SCM 的早期诊断和干预提供了一个新的分子靶点。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9873/11501391/6fda4142db5b/aging-16-206092-g001.jpg

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