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使用邻近连接分析法检测蛋白质-蛋白质相互作用的改进方法。

Improved method for detecting protein-protein interactions using proximity ligation assay.

作者信息

Tower Zach, Chang Hao

机构信息

Department of Dermatology, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin 53705.

William S. Middleton VA Medical Center, Madison, Wisconsin 53705.

出版信息

bioRxiv. 2024 Sep 2:2024.09.01.610697. doi: 10.1101/2024.09.01.610697.

DOI:10.1101/2024.09.01.610697
PMID:39282310
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11398341/
Abstract

Proximity ligation assay has been widely used to detect protein-protein interaction in cells and tissues. While with great sensitivity, its specificity was often neglected. Here, we report the existence of varying levels of false positives observed with this assay and provide suggestions to minimize false positives for more accurate detection of protein-protein interactions, especially for membrane proteins.

摘要

邻近连接分析已被广泛用于检测细胞和组织中的蛋白质-蛋白质相互作用。尽管该方法具有很高的灵敏度，但其特异性却常常被忽视。在此，我们报告了使用该分析方法观察到的不同程度假阳性的存在情况，并提供了一些建议，以尽量减少假阳性，从而更准确地检测蛋白质-蛋白质相互作用，尤其是对于膜蛋白。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/768f/11398341/d39b7ed5859d/nihpp-2024.09.01.610697v1-f0002.jpg
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