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VTX:实时高性能分子结构与动力学可视化软件。

VTX: real-time high-performance molecular structure and dynamics visualization software.

作者信息

Maria Maxime, Guionnière Simon, Dacquay Nicolas, Plateau-Holleville Cyprien, Guillaume Valentin, Larroque Vincent, Lardé Jean, Naimi Yassine, Piquemal Jean-Philip, Levieux Guillaume, Lagarde Nathalie, Mérillou Stéphane, Montes Matthieu

机构信息

XLIM, UMR CNRS 7252, Université de Limoges, 87000 Limoges, France.

Laboratoire GBCM, EA 7528, Conservatoire National des Arts et Métiers, 75003 Paris, France.

出版信息

Bioinformatics. 2025 Jun 2;41(6). doi: 10.1093/bioinformatics/btaf295.

DOI:10.1093/bioinformatics/btaf295
PMID:40353852
Abstract

SUMMARY

VTX is a molecular visualization software capable to handle most molecular structures and dynamics trajectories file formats. It features a real-time high-performance molecular graphics engine, based on modern OpenGL, optimized for the visualization of massive molecular systems and molecular dynamics trajectories. VTX includes multiple interactive camera and user interaction features, notably free-fly navigation and a fully modular graphical user interface designed for increased usability. It allows the production of high-resolution images for presentations and posters with custom background. VTX design is focused on performance and usability for research, teaching, and educative purposes.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

VTX is open source and free for non-commercial use. Builds for Windows and Ubuntu Linux are available at http://vtx.drugdesign.fr. The source code is available at https://github.com/VTX-Molecular-Visualization.

摘要

摘要

VTX是一款分子可视化软件,能够处理大多数分子结构和动力学轨迹文件格式。它具有基于现代OpenGL的实时高性能分子图形引擎,针对大规模分子系统和分子动力学轨迹的可视化进行了优化。VTX包括多个交互式相机和用户交互功能,特别是自由飞行导航和专为提高可用性而设计的完全模块化图形用户界面。它允许生成带有自定义背景的用于演示和海报的高分辨率图像。VTX的设计侧重于研究、教学和教育目的的性能和可用性。

可用性与实现方式

VTX是开源的,非商业用途免费。可在http://vtx.drugdesign.fr获取适用于Windows和Ubuntu Linux的版本。源代码可在https://github.com/VTX-Molecular-Visualization获取。

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