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菌株PSC-1基因组组装的改进。

Improved assembly of the strain PSC-1 genome.

作者信息

Fabrega Aldair, Ortega Ana Cristina, Pardo Letizia, Restrepo Carlos M, Llanes Alejandro

机构信息

División de Salud Humana y Enfermedades, Instituto de Investigaciones Científicas y Servicios de Alta Tecnología AIP (INDICASAT-AIP), Panama City, Panama.

Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Latina de Panamá, Panama City, Panama.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Aug 14;14(8):e0062725. doi: 10.1128/mra.00627-25. Epub 2025 Jul 21.

Abstract

is a causative agent of leishmaniasis in Latin America, with significant incidence in Panama and Colombia. The first annotated genome draft for this parasite remained incomplete due to its highly repetitive nature. Here, we combined short- and long-read sequencing data to improve this genome draft.

摘要

是拉丁美洲利什曼病的病原体,在巴拿马和哥伦比亚发病率很高。由于其高度重复的性质,该寄生虫的首个注释基因组草图仍不完整。在此,我们结合了短读长和长读长测序数据来改进这个基因组草图。

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Interventions for Old World cutaneous leishmaniasis.旧世界皮肤利什曼病的干预措施。
Cochrane Database Syst Rev. 2017 Nov 17;11(11):CD005067. doi: 10.1002/14651858.CD005067.pub4.
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本文引用的文献

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Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences.Minimap2:核苷酸序列的两两比对。
Bioinformatics. 2018 Sep 15;34(18):3094-3100. doi: 10.1093/bioinformatics/bty191.

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