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黑腹果蝇5S RNA基因簇内转录活性和非活性基因重复序列。

Transcriptionally active and inactive gene repeats within the D. melanogaster 5S RNA gene cluster.

作者信息

Sharp S, Garcia A, Cooley L, Söll D

出版信息

Nucleic Acids Res. 1984 Oct 25;12(20):7617-32. doi: 10.1093/nar/12.20.7617.

DOI:10.1093/nar/12.20.7617
PMID:6093044
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC320189/
Abstract

Transcription of isolated repeat units of D. melanogaster 5S DNA in a Drosophila KcO cell extract revealed three types of template activities. 5SI DNA encodes the known 5S rRNA of D. melanogaster and has a relatively high transcription efficiency. 5SII DNA is identical to 5SI DNA except for a two-nucleotide deletion at 5S rRNA positions 28 and 29; the efficiency of transcription is approximately 40% that of 5SI DNA and because of the deletion, the primary transcript is two nucleotides shorter. 5SIII DNA does not support in vitro transcription (less than 2% 5SI DNA), but has the same sequence as 5SI DNA except for a single G to A transition at position 86. This is the first reported point-mutation in a 5S RNA gene resulting in loss of transcription function. Of approximately 23 5S rRNA gene copies in a cloned 5S DNA sub-cluster (p12D1) 19 appear to be of the transcriptionally inactive 5SIII DNA type.

摘要

在果蝇KcO细胞提取物中对黑腹果蝇5S DNA的分离重复单元进行转录,发现了三种类型的模板活性。5SI DNA编码黑腹果蝇已知的5S rRNA,转录效率相对较高。5SII DNA与5SI DNA相同,只是在5S rRNA的第28和29位有两个核苷酸缺失;转录效率约为5SI DNA的40%,由于缺失,初级转录本短两个核苷酸。5SIII DNA不支持体外转录(不到5SI DNA的2%),但除了在第86位有一个单一的G到A转换外,其序列与5SI DNA相同。这是首次报道的5S RNA基因中的点突变导致转录功能丧失。在一个克隆的5S DNA亚簇(p12D1)中约23个5S rRNA基因拷贝中,19个似乎是转录无活性的5SIII DNA类型。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1013/320189/c0ebd567a0ae/nar00338-0022-a.jpg
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