• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

汞对蛋白酶K抑制作用的研究。

Studies on the inhibitory action of mercury upon proteinase K.

作者信息

Müller A, Saenger W

机构信息

Institut für Kristallographie, Freie Universität Berlin, Federal Republic of Germany.

出版信息

J Biol Chem. 1993 Dec 15;268(35):26150-4.

PMID:8253733
Abstract

In proteinase K, Cys73 is located "below" the imidazole of the active site His69. In a 2.4-A resolution x-ray crystal structure of the complex formed between the enzyme and HgAc2, two Hg(II) positions are found: a fully occupied site, covalently bound to Cys73 (S gamma), which disrupts the catalytic triad (Asp39-His69-Ser224), and a 2-fold disordered (25 and 35% occupancy), noncovalent complexation to His72, Cys73, and Thr76 of lower affinity. The enzyme is inhibited noncompetitively at low concentrations and competitively above stoichiometric concentrations of Hg(II), but it retains 7% residual activity. This can be rationalized if the molecule is flexible enough to permit transient formation of the catalytic triad. Except for the active site, only minor structural changes are observed upon binding of Hg(II), but the thermal stability is reduced by 4 degrees C.

摘要

在蛋白酶K中,半胱氨酸73位于活性位点组氨酸69的咪唑“下方”。在该酶与HgAc2形成的复合物的2.4埃分辨率X射线晶体结构中,发现了两个汞(II)位置:一个完全占据的位点,与半胱氨酸73(Sγ)共价结合,这破坏了催化三联体(天冬氨酸39-组氨酸69-丝氨酸224);另一个是与组氨酸72、半胱氨酸73和苏氨酸76形成的2倍无序(占有率为25%和35%)、亲和力较低的非共价络合物。该酶在低浓度下受到非竞争性抑制,在汞(II)化学计量浓度以上受到竞争性抑制,但仍保留7%的残余活性。如果分子足够灵活以允许催化三联体的瞬时形成,这是可以解释的。除活性位点外,汞(II)结合后仅观察到微小的结构变化,但热稳定性降低了4摄氏度。

相似文献

1
Studies on the inhibitory action of mercury upon proteinase K.汞对蛋白酶K抑制作用的研究。
J Biol Chem. 1993 Dec 15;268(35):26150-4.
2
Crystal structure of calcium-free proteinase K at 1.5-A resolution.分辨率为1.5埃的无钙蛋白酶K的晶体结构。
J Biol Chem. 1994 Sep 16;269(37):23108-11. doi: 10.2210/pdb2pkc/pdb.
3
Three-dimensional structure of proteinase K at 0.15-nm resolution.分辨率为0.15纳米的蛋白酶K的三维结构。
Eur J Biochem. 1988 Dec 1;178(1):155-71. doi: 10.1111/j.1432-1033.1988.tb14440.x.
4
Impact of Mercury(II) on proteinase K catalytic center: investigations via classical and Born-Oppenheimer molecular dynamics.汞(II)对蛋白酶 K 催化中心的影响:通过经典和 Born-Oppenheimer 分子动力学研究。
Mol Divers. 2011 Feb;15(1):215-26. doi: 10.1007/s11030-010-9256-3. Epub 2010 May 20.
5
Binding of mercury(II) to protein thiol groups: a study of proteinase K and carboxypeptidase Y.汞(II)与蛋白质硫醇基团的结合:蛋白酶K和羧肽酶Y的研究
J Inorg Biochem. 1991 May 1;42(2):97-103. doi: 10.1016/0162-0134(91)80036-h.
6
Enhancement of catalytic efficiency of enzymes through exposure to anhydrous organic solvent at 70 degrees C. Three-dimensional structure of a treated serine proteinase at 2.2 A resolution.
Proteins. 2000 May 15;39(3):226-34. doi: 10.1002/(sici)1097-0134(20000515)39:3<226::aid-prot50>3.0.co;2-y.
7
Enhancement of catalytic activity of enzymes by heating in anhydrous organic solvents: 3D structure of a modified serine proteinase at high resolution.通过在无水有机溶剂中加热增强酶的催化活性:高分辨率下一种修饰丝氨酸蛋白酶的三维结构。
Indian J Biochem Biophys. 2001 Feb-Apr;38(1-2):34-41.
8
Mercury induced modifications in the stereochemistry of the active site through Cys-73 in a serine protease--crystal structure of the complex of a partially modified proteinase K with mercury at 1.8 A resolution.汞通过丝氨酸蛋白酶中的半胱氨酸-73诱导活性位点立体化学的修饰——部分修饰的蛋白酶K与汞复合物在1.8埃分辨率下的晶体结构。
Indian J Biochem Biophys. 2001 Oct;38(5):298-302.
9
Structure of a ternary complex of proteinase K, mercury, and a substrate-analogue hexa-peptide at 2.2 A resolution.分辨率为2.2埃的蛋白酶K、汞和底物类似物六肽三元复合物的结构。
Proteins. 1996 Jun;25(2):195-201. doi: 10.1002/(SICI)1097-0134(199606)25:2<195::AID-PROT5>3.0.CO;2-H.
10
The three-dimensional structure of the complex of proteinase K with its naturally occurring protein inhibitor, PKI3.蛋白酶K与其天然存在的蛋白质抑制剂PKI3复合物的三维结构。
FEBS Lett. 1994 Mar 21;341(2-3):167-70. doi: 10.1016/0014-5793(94)80450-8.

引用本文的文献

1
A Workflow for Protein Structure Determination From Thin Crystal Lamella by Micro-Electron Diffraction.一种通过微电子衍射从薄晶体薄片确定蛋白质结构的工作流程。
Front Mol Biosci. 2020 Aug 4;7:179. doi: 10.3389/fmolb.2020.00179. eCollection 2020.
2
Impact of metal ions on PCR inhibition and RT-PCR efficiency.金属离子对 PCR 抑制和 RT-PCR 效率的影响。
Int J Legal Med. 2021 Jan;135(1):63-72. doi: 10.1007/s00414-020-02363-4. Epub 2020 Jul 3.
3
Relevance of arginine residues in Cu(II)-induced DNA breakage and Proteinase K resistance of H1 histones.
精氨酸残基在 Cu(II)诱导的 DNA 断裂和组蛋白 H1 的蛋白酶 K 抗性中的相关性。
Sci Rep. 2018 May 9;8(1):7414. doi: 10.1038/s41598-018-25784-z.
4
Avoidable errors in deposited macromolecular structures: an impediment to efficient data mining.避免沉积大分子结构中的错误:高效数据挖掘的障碍。
IUCrJ. 2014 Apr 14;1(Pt 3):179-93. doi: 10.1107/S2052252514005442. eCollection 2014 May 1.
5
Impact of Mercury(II) on proteinase K catalytic center: investigations via classical and Born-Oppenheimer molecular dynamics.汞(II)对蛋白酶 K 催化中心的影响:通过经典和 Born-Oppenheimer 分子动力学研究。
Mol Divers. 2011 Feb;15(1):215-26. doi: 10.1007/s11030-010-9256-3. Epub 2010 May 20.
6
C-Npys (S-3-nitro-2-pyridinesulfenyl) and peptide derivatives can inhibit a serine-thiol proteinase activity from Paracoccidioides brasiliensis.C-Npys(S-3-硝基-2-吡啶基亚磺酰基)及其肽衍生物能够抑制巴西副球孢子菌的一种丝氨酸-硫醇蛋白酶活性。
Biochem Biophys Res Commun. 2007 Apr 20;355(4):1000-5. doi: 10.1016/j.bbrc.2007.02.070. Epub 2007 Feb 23.