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Effective large-scale sequence similarity searches.

作者信息

Claverie J M

机构信息

Laboratory of Structural and Genetic Information, E.P.91-Centre National de la Recherche Scientifique, Marseille, France.

出版信息

Methods Enzymol. 1996;266:212-27. doi: 10.1016/s0076-6879(96)66016-9.

DOI:10.1016/s0076-6879(96)66016-9
PMID:8743687
Abstract
摘要

相似文献

1
Effective large-scale sequence similarity searches.有效的大规模序列相似性搜索。
Methods Enzymol. 1996;266:212-27. doi: 10.1016/s0076-6879(96)66016-9.
2
Applying motif and profile searches.应用基序和轮廓搜索。
Methods Enzymol. 1996;266:162-84. doi: 10.1016/s0076-6879(96)66013-3.
3
Exon detection by similarity searches.
Methods Mol Biol. 1997;68:283-313. doi: 10.1385/0-89603-482-8:283.
4
Finding genes by computer: the state of the art.
Trends Genet. 1996 Aug;12(8):316-20. doi: 10.1016/0168-9525(96)10038-x.
5
Combined DNA and protein alignment.DNA与蛋白质联合比对。
Methods Enzymol. 1996;266:402-18. doi: 10.1016/s0076-6879(96)66025-x.
6
Detection and characterization of transposable elements.
Methods Enzymol. 1993;224:322-34. doi: 10.1016/0076-6879(93)24024-o.
7
Comparison of various algorithms for recognizing short coding sequences of human genes.用于识别人类基因短编码序列的各种算法的比较。
Bioinformatics. 2004 Mar 22;20(5):673-81. doi: 10.1093/bioinformatics/btg467. Epub 2004 Feb 5.
8
Kallmann syndrome gene on the X and Y chromosomes: implications for evolutionary divergence of human sex chromosomes.
Nat Genet. 1992 Dec;2(4):311-4. doi: 10.1038/ng1292-311.
9
Parametric and inverse-parametric sequence alignment with XPARAL.使用XPARAL进行参数化和逆参数化序列比对。
Methods Enzymol. 1996;266:481-94. doi: 10.1016/s0076-6879(96)66030-3.
10
The prediction of exons through an analysis of spliceable open reading frames.通过对可剪接开放阅读框的分析来预测外显子。
Nucleic Acids Res. 1992 Jul 11;20(13):3453-62. doi: 10.1093/nar/20.13.3453.

引用本文的文献

1
PipeOnline 2.0: automated EST processing and functional data sorting.PipeOnline 2.0：EST自动化处理与功能数据分类
Nucleic Acids Res. 2002 Nov 1;30(21):4761-9. doi: 10.1093/nar/gkf585.
2
Computational methods for exon detection.外显子检测的计算方法。
Mol Biotechnol. 1998 Aug;10(1):27-48. doi: 10.1007/BF02745861.