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嗜热栖热菌延伸因子 Ts 中二聚化结构域的结构与重要性

Structure and importance of the dimerization domain in elongation factor Ts from Thermus thermophilus.

作者信息

Jiang Y, Nock S, Nesper M, Sprinzl M, Sigler P B

机构信息

Department of Chemistry, Howard Hughes Medical Institute, Yale University, New Haven, Connecticut 06520, USA.

出版信息

Biochemistry. 1996 Aug 13;35(32):10269-78. doi: 10.1021/bi960918w.

Abstract

Elongation factor Ts (EF-Ts) functions as a nucleotide-exchange factor by binding elongation factor Tu (EF-Tu) and accelerating the GDP dissociation from EF-Tu; thus EF-Ts promotes the transition of EF-Tu from the inactive GDP form to the active GTP form. Thermus thermophilus EF-Ts exists as a stable dimer in solution which binds two molecules of EF-Tu to form a (EF-Tu.EF-Ts)2 heterotetramer. Here we report the crystal structure of the dimerization domain of EF-Ts from T. thermophilus refined to 1.7 A resolution. A three-stranded antiparallel beta-sheet from each subunit interacts to form a beta-sandwich that serves as an extensive dimer interface tethered by a disulfide bond. This interface is distinctly different from the predominantly alpha-helical one that stabilizes the EF-Ts dimer from Escherichia coli [Kawashima, T., et al. (1996) Nature 379, 511-518]. To test whether the homodimeric form of T. thermophilus EF-Ts is necessary for catalyzing nucleotide exchange, the present structure was used to design mutational changes within the dimer interface that disrupt the T. thermophilus EF-Ts dimer but not the tertiary structure of the subunits. Surprisingly, EF-Ts monomers created in this manner failed to catalyze nucleotide exchange in EF-Tu, indicating that, in vitro. T. thermophilus EF-Ts functions only as a homodimer.

摘要

延伸因子 Ts(EF-Ts)通过结合延伸因子 Tu(EF-Tu)并加速 GDP 从 EF-Tu 上解离而作为核苷酸交换因子发挥作用;因此,EF-Ts 促进 EF-Tu 从无活性的 GDP 形式转变为有活性的 GTP 形式。嗜热栖热菌 EF-Ts 在溶液中以稳定的二聚体形式存在,它结合两个 EF-Tu 分子形成一个(EF-Tu·EF-Ts)2 异源四聚体。在此,我们报道了嗜热栖热菌 EF-Ts 二聚化结构域的晶体结构,其精修至 1.7 Å 分辨率。每个亚基的一个三链反平行β-折叠相互作用形成一个β-三明治结构,该结构作为由二硫键连接的广泛二聚体界面。这个界面与主要由α-螺旋稳定大肠杆菌 EF-Ts 二聚体的界面明显不同[河岛,T.,等人(1996 年)《自然》379,511 - 518]。为了测试嗜热栖热菌 EF-Ts 的同型二聚体形式对于催化核苷酸交换是否必要,利用当前结构设计二聚体界面内的突变变化,这些变化破坏嗜热栖热菌 EF-Ts 二聚体但不破坏亚基的三级结构。令人惊讶的是,以这种方式产生的 EF-Ts 单体未能催化 EF-Tu 中的核苷酸交换,表明在体外,嗜热栖热菌 EF-Ts 仅作为同型二聚体发挥作用。

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