• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种用于估计和比较突变率的改良鲁里亚-德尔布吕克波动试验。

A modified Luria-Delbrück fluctuation assay for estimating and comparing mutation rates.

作者信息

Crane G J, Thomas S M, Jones M E

机构信息

School of Medicine 6E-413, Flinders University of South Australia, Adelaide, Australia.

出版信息

Mutat Res. 1996 Jul 22;354(2):171-82. doi: 10.1016/0027-5107(96)00009-7.

DOI:10.1016/0027-5107(96)00009-7
PMID:8764946
Abstract

We have investigated the accuracy with which mutation rates may be estimated using a modification of the Luria and Delbrück fluctuation experiment protocol. The modification involves growing a larger-than-usual culture, and plating out a small aliquot of it. Monte Carlo simulations of the experiments confirm that the modification leads to a decrease in the coefficient of variation of the estimated mutation rate where this is based on the median number of mutants detected in a number of cultures grown in parallel. If sets of experimental and control cultures are compared using the Mann-Whitney U-test, then fractional increases in mutation rate can be reliably detected using relatively small numbers of cultures. The modified protocols promise better estimates of mutation rates, offer a powerful test of differences in mutation rates, and are easier to implement in practice.

摘要

我们研究了使用改良的卢里亚-德尔布吕克波动实验方案来估计突变率的准确性。这种改良包括培养比平常更大的培养物,并接种一小份该培养物。实验的蒙特卡罗模拟证实,这种改良会使基于在多个平行培养的培养物中检测到的突变体中位数估计的突变率变异系数降低。如果使用曼-惠特尼U检验比较实验组和对照组培养物,那么使用相对少量的培养物就能可靠地检测到突变率的分数增加。改良后的方案有望更好地估计突变率,提供对突变率差异的有力检验,并且在实践中更易于实施。

相似文献

1
A modified Luria-Delbrück fluctuation assay for estimating and comparing mutation rates.一种用于估计和比较突变率的改良鲁里亚-德尔布吕克波动试验。
Mutat Res. 1996 Jul 22;354(2):171-82. doi: 10.1016/0027-5107(96)00009-7.
2
[Starvation-induced mutagenesis in Salmonella typhimurium].[鼠伤寒沙门氏菌中的饥饿诱导诱变]
Genetika. 1995 Oct;31(10):1380-5.
3
New approaches to mutation rate fold change in Luria-Delbrück fluctuation experiments.鲁里亚-德尔布吕克波动实验中突变率变化倍数的新方法。
Math Biosci. 2021 May;335:108572. doi: 10.1016/j.mbs.2021.108572. Epub 2021 Mar 1.
4
Comparing mutation rates under the Luria-Delbrück protocol.比较卢里亚-德尔布吕克实验方案下的突变率。
Genetica. 2016 Jun;144(3):351-9. doi: 10.1007/s10709-016-9904-3. Epub 2016 May 17.
5
Luria-Delbrück fluctuation analysis: estimating the Poisson parameter in a compound Poisson distribution.卢里亚-德尔布吕克波动分析:估计复合泊松分布中的泊松参数。
Comput Biol Med. 1993 Nov;23(6):525-34. doi: 10.1016/0010-4825(93)90099-m.
6
Efficient, robust, and versatile fluctuation data analysis using MLE MUtation Rate calculator (mlemur).使用最大似然估计突变率计算器(mlemur)进行高效、稳健且多功能的波动数据分析。
Mutat Res. 2023 Jan-Jun;826:111816. doi: 10.1016/j.mrfmmm.2023.111816. Epub 2023 Apr 13.
7
A robust estimator of mutation rates.一种可靠的突变率估计方法。
Mutat Res. 2009 Feb 10;661(1-2):101-9. doi: 10.1016/j.mrfmmm.2008.11.015. Epub 2008 Dec 3.
8
Unbiased estimation of mutation rates under fluctuating final counts.波动最终计数下突变率的无偏估计。
PLoS One. 2014 Jul 2;9(7):e101434. doi: 10.1371/journal.pone.0101434. eCollection 2014.
9
Mean field mutation dynamics and the continuous Luria-Delbrück distribution.平均场突变动力学和连续 Luria-Delbrück 分布。
Math Biosci. 2012 Dec;240(2):223-30. doi: 10.1016/j.mbs.2012.08.001. Epub 2012 Aug 21.
10
Methods for comparing mutation rates using fluctuation assay data.利用波动试验数据比较突变率的方法。
Mutat Res. 2015 Jul;777:20-2. doi: 10.1016/j.mrfmmm.2015.04.002. Epub 2015 Apr 9.

引用本文的文献

1
Experimental bacterial adaptation to the zebrafish gut reveals a primary role for immigration.实验细菌对斑马鱼肠道的适应性表明,移民是主要作用。
PLoS Biol. 2018 Dec 10;16(12):e2006893. doi: 10.1371/journal.pbio.2006893. eCollection 2018 Dec.
2
High mutation rates limit evolutionary adaptation in Escherichia coli.高突变率限制了大肠杆菌的进化适应。
PLoS Genet. 2018 Apr 27;14(4):e1007324. doi: 10.1371/journal.pgen.1007324. eCollection 2018 Apr.
3
Comparing mutation rates under the Luria-Delbrück protocol.比较卢里亚-德尔布吕克实验方案下的突变率。
Genetica. 2016 Jun;144(3):351-9. doi: 10.1007/s10709-016-9904-3. Epub 2016 May 17.
4
Genetic Basis and Functional Consequences of Differential Expression of the CmeABC Efflux Pump in Campylobacter jejuni Isolates.空肠弯曲菌分离株中CmeABC外排泵差异表达的遗传基础及功能后果
PLoS One. 2015 Jul 1;10(7):e0131534. doi: 10.1371/journal.pone.0131534. eCollection 2015.
5
A Bayesian two-level model for fluctuation assay.一种用于波动试验的贝叶斯两级模型。
Genetica. 2011 Dec;139(11-12):1409-16. doi: 10.1007/s10709-012-9639-8. Epub 2012 Mar 7.
6
Role of Klebsiella pneumoniae LamB Porin in antimicrobial resistance.肺炎克雷伯菌 LamB 孔蛋白在抗菌药物耐药性中的作用。
Antimicrob Agents Chemother. 2011 Apr;55(4):1803-5. doi: 10.1128/AAC.01441-10. Epub 2011 Jan 31.
7
A MATE-family efflux pump rescues the Escherichia coli 8-oxoguanine-repair-deficient mutator phenotype and protects against H(2)O(2) killing.一种 MATE 家族外排泵挽救了大肠杆菌 8-氧鸟嘌呤修复缺陷型突变体表型,并防止了 H₂O₂的杀伤。
PLoS Genet. 2010 May 6;6(5):e1000931. doi: 10.1371/journal.pgen.1000931.
8
In vitro antibacterial activities of JNJ-Q2, a new broad-spectrum fluoroquinolone.JNJ-Q2,一种新型氟喹诺酮类药物的体外抗菌活性。
Antimicrob Agents Chemother. 2010 May;54(5):1955-64. doi: 10.1128/AAC.01374-09. Epub 2010 Feb 22.
9
A simple formula for obtaining markedly improved mutation rate estimates.一种用于获得显著改进的突变率估计值的简单公式。
Genetics. 2008 Nov;180(3):1773-8. doi: 10.1534/genetics.108.091777. Epub 2008 Oct 1.
10
A practical guide to measuring mutation rates in antibiotic resistance.测量抗生素耐药性突变率的实用指南。
Antimicrob Agents Chemother. 2008 Apr;52(4):1209-14. doi: 10.1128/AAC.01152-07. Epub 2008 Feb 4.