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使用传递/不平衡检验和基于单倍型的单倍型相对风险对复杂疾病基因进行基因组扫描。

Genome scanning for complex disease genes using the transmission/disequilibrium test and haplotype-based haplotype relative risk.

作者信息

Matise T C

机构信息

Department of Psychiatry, Columbia University, New York, NY 10032, USA.

出版信息

Genet Epidemiol. 1995;12(6):641-5. doi: 10.1002/gepi.1370120620.

DOI:10.1002/gepi.1370120620
PMID:8787987
Abstract

Two tests for allelic association were applied to a simulated complex disease for the Genetic Analysis Workshop 9. The transmission/disequilibrium test [Spielman et al., 1993] and the haplotype-based haplotype relative risk approach [Terwilliger and Ott, 1992] were used to detect disease-associated alleles in a set of 360 computer-simulated markers located on six chromosomes and genotyped in 200 nuclear families. This analysis emulates a genome-based search for linked markers. Computer simulations were also performed to clarify statistical properties of the TDT.

摘要

针对遗传分析研讨会9的模拟复杂疾病,应用了两种等位基因关联测试。采用传递/不平衡测试[斯皮尔曼等人,1993年]和基于单倍型的单倍型相对风险方法[特威利格和奥特,1992年],在位于6条染色体上的360个计算机模拟标记集中检测疾病相关等位基因,并对200个核心家庭进行基因分型。该分析模拟了基于基因组的连锁标记搜索。还进行了计算机模拟以阐明传递/不平衡测试的统计特性。

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引用本文的文献

1
A transmission/disequilibrium test that allows for genotyping errors in the analysis of single-nucleotide polymorphism data.一种在单核苷酸多态性数据分析中允许基因分型错误的传递/不平衡检验。
Am J Hum Genet. 2001 Aug;69(2):371-80. doi: 10.1086/321981. Epub 2001 Jul 5.