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计算机分析揭示了线虫秀丽隐杆线虫中一种类似流浪汉元件,它呈现出与Tc1-水手转座子家族共有的保守转座酶结构域。

Computer analyses reveal a hobo-like element in the nematode Caenorhabditis elegans, which presents a conserved transposase domain common with the Tc1-Mariner transposon family.

作者信息

Bigot Y, Augé-Gouillou C, Periquet G

机构信息

Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte, Faculté des Sciences, Tours, France.

出版信息

Gene. 1996 Oct 3;174(2):265-71. doi: 10.1016/0378-1119(96)00092-3.

DOI:10.1016/0378-1119(96)00092-3
PMID:8890745
Abstract

The present report describes the use of computer analyses to reveal a hobo-like element in the genome of Caenorhabditis elegans. This hobo-like sequence is 3039 bp long, contains two inverted terminal repeats of 25-27 bp and probably does not encoded a functional transposase. Sequence comparisons suggest that each transposase of hobo elements probably has a D(D/S)E motif. Thus the transposases of the hAT superfamily of transposons appear to be close to the other transposases and intregrases.

摘要

本报告描述了利用计算机分析在秀丽隐杆线虫基因组中发现一种类hobo元件。这种类hobo序列长3039 bp,包含两个25 - 27 bp的反向末端重复序列,可能不编码功能性转座酶。序列比较表明,hobo元件的每个转座酶可能都有一个D(D/S)E基序。因此,转座子hAT超家族的转座酶似乎与其他转座酶和整合酶关系密切。

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