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轻度条件下人类α1-抗胰蛋白酶反应位点环行为的计算机模拟

Computer modelling of human alpha 1-antitrypsin reactive site loop behaviour under mild conditions.

作者信息

Kołoczek H, Jezierski G, Pasenkiewicz-Gierula M

机构信息

Department of Physical Biochemistry, Jagiellonian University, Cracow, Poland.

出版信息

Acta Biochim Pol. 1996;43(3):467-74.

PMID:8922028
Abstract

Human alpha 1-antitrypsin (alpha 1-PI) is a member of the serpin superfamily of proteins. The reactive site loop (RSL) of the serpin binds to the active site of its target proteinase. Deficiency of alpha 1-antitrypsin is associated with a spontaneous conformational transition in the molecule which leads to a polymer formation. Mild conditions (1 M guanidinium.HCl), temperature and point mutations within the RSL are the factors that induce polymerisation. Initiation of this process has been associated with the disruption of a salt bridge Glu342-->Lys290. In this paper the interaction of guanidinium ion with Glu342 and Lys290 as well as the effect of this interaction on the mobility of RSL is studied by molecular modelling.

摘要

人α1-抗胰蛋白酶(α1-PI)是丝氨酸蛋白酶抑制剂超家族蛋白的成员。丝氨酸蛋白酶抑制剂的反应性位点环(RSL)与其靶蛋白酶的活性位点结合。α1-抗胰蛋白酶缺乏与分子中自发的构象转变有关,这种转变会导致聚合物形成。温和条件(1M盐酸胍)、温度和RSL内的点突变是诱导聚合的因素。该过程的起始与盐桥Glu342→Lys290的破坏有关。本文通过分子建模研究了胍离子与Glu342和Lys290的相互作用以及这种相互作用对RSL迁移率的影响。

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