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NRSub数据库：1997年更新

The NRSub database: update 1997.

作者信息

Perrière G, Moszer I, Gojobori T

机构信息

Laboratoire de Biométrie, Génétique et Biologie des Populations, Université Claude Bernard, Lyon 1, 43, bd. du 11 Novembre 1918, 69622 Villeurbanne Cedex, France.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):53-6. doi: 10.1093/nar/25.1.53.

DOI:10.1093/nar/25.1.53
PMID:9016504
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC146364/
Abstract

In the context of the international project aiming at sequencing the whole genome of Bacillus subtilis we have developed NRSub, a non-redundant database of sequences from this organism. Starting from the B.subtilis sequences available in the repository collections we have removed all encountered duplications, then we have added extra annotations to the sequences (e.g. accession numbers for the genes, locations on the genetic map, codon usage index). We have also added cross-references with EMBL/GenBank/DDBJ, MEDLINE, SWISS-PROT and ENZYME databases. NRSub is distributed through anonymous FTP as a text file in EMBL format and as an ACNUC database. It is also possible to access the database through two dedicated World Wide Web servers located in France (http://acnuc.univ-lyon1.fr/nrsub/nrsub.++ +html ) and in Japan (http://ddbjs4h.genes.nig.ac.jp/ ).

摘要

在旨在对枯草芽孢杆菌全基因组进行测序的国际项目背景下，我们开发了NRSub，这是一个该生物体的非冗余序列数据库。从存储库集合中可用的枯草芽孢杆菌序列开始，我们去除了所有遇到的重复序列，然后为这些序列添加了额外的注释（例如基因的登录号、遗传图谱上的位置、密码子使用指数）。我们还添加了与EMBL/GenBank/DDBJ、MEDLINE、SWISS-PROT和ENZYME数据库的交叉引用。NRSub通过匿名FTP以EMBL格式的文本文件和ACNUC数据库的形式分发。也可以通过位于法国（http://acnuc.univ-lyon1.fr/nrsub/nrsub.++ +html ）和日本（http://ddbjs4h.genes.nig.ac.jp/ ）的两个专用万维网服务器访问该数据库。

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