• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
NRSub: a non-redundant database for Bacillus subtilis.NRSub：一个用于枯草芽孢杆菌的非冗余数据库。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):41-5. doi: 10.1093/nar/24.1.41.
2
The NRSub database: update 1997.NRSub数据库：1997年更新
Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):53-6. doi: 10.1093/nar/25.1.53.
3
The non-redundant Bacillus subtilis (NRSub) database: update 1998.非冗余枯草芽孢杆菌（NRSub）数据库：1998年更新
Nucleic Acids Res. 1998 Jan 1;26(1):60-2. doi: 10.1093/nar/26.1.60.
4
NRSub: a non-redundant data base for the Bacillus subtilis genome.NRSub：枯草芽孢杆菌基因组的一个非冗余数据库。
Nucleic Acids Res. 1994 Dec 25;22(25):5525-9. doi: 10.1093/nar/22.25.5525.
5
SubtiList: a relational database for the Bacillus subtilis genome.枯草芽孢杆菌列表：一个关于枯草芽孢杆菌基因组的关系型数据库。
Microbiology (Reading). 1995 Feb;141 ( Pt 2):261-8. doi: 10.1099/13500872-141-2-261.
6
SubtiList: the reference database for the Bacillus subtilis genome.枯草芽孢杆菌基因组参考数据库：枯草芽孢杆菌列表
Nucleic Acids Res. 2002 Jan 1;30(1):62-5. doi: 10.1093/nar/30.1.62.
7
The complete genome of Bacillus subtilis: from sequence annotation to data management and analysis.枯草芽孢杆菌的全基因组：从序列注释到数据管理与分析
FEBS Lett. 1998 Jun 23;430(1-2):28-36. doi: 10.1016/s0014-5793(98)00620-6.
8
The European Bacillus subtilis genome sequencing project: current status and accessibility of the data from a new World Wide Web site.欧洲枯草芽孢杆菌基因组测序项目：来自一个新万维网站点的数据现状及可获取性
Microbiology (Reading). 1996 Nov;142 ( Pt 11):2987-91. doi: 10.1099/13500872-142-11-2987.
9
On-line tools for sequence retrieval and multivariate statistics in molecular biology.分子生物学中用于序列检索和多元统计的在线工具。
Comput Appl Biosci. 1996 Feb;12(1):63-9. doi: 10.1093/bioinformatics/12.1.63.
10
Micado--a network-oriented database for microbial genomes.米卡多——一个面向网络的微生物基因组数据库。
Comput Appl Biosci. 1997 Aug;13(4):431-8. doi: 10.1093/bioinformatics/13.4.431.

本文引用的文献

1
Transforming a set of biological flat file libraries to a fast access network.将一组生物平面文件库转换为快速访问网络。
Comput Appl Biosci. 1993 Feb;9(1):59-64. doi: 10.1093/bioinformatics/9.1.59.
2
SRS--an indexing and retrieval tool for flat file data libraries.SRS——一种用于平面文件数据库的索引和检索工具。
Comput Appl Biosci. 1993 Feb;9(1):49-57. doi: 10.1093/bioinformatics/9.1.49.
3
ColiGene: object-centered representation for the study of E coli gene expressivity by sequence analysis.ColiGene：用于通过序列分析研究大肠杆菌基因表达性的以对象为中心的表示法。
Biochimie. 1993;75(5):415-22.
4
HOVERGEN: a database of homologous vertebrate genes.HOVERGEN：一个脊椎动物同源基因数据库。
Nucleic Acids Res. 1994 Jun 25;22(12):2360-5. doi: 10.1093/nar/22.12.2360.
5
Intrinsic and extrinsic approaches for detecting genes in a bacterial genome.检测细菌基因组中基因的内在和外在方法。
Nucleic Acids Res. 1994 Nov 11;22(22):4756-67. doi: 10.1093/nar/22.22.4756.
6
The ENZYME data bank.酶数据库。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3626-7.
7
The SWISS-PROT protein sequence data bank: current status.SWISS-PROT蛋白质序列数据库：现状
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3578-80.
8
The PIR-International Protein Sequence Database.PIR国际蛋白质序列数据库。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3569-73.
9
The European Bioinformatics Institute (EBI) databases.欧洲生物信息学研究所（EBI）数据库。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3445-9. doi: 10.1093/nar/22.17.3445.
10
GenBank.基因银行
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3441-4. doi: 10.1093/nar/22.17.3441.

NRSub：一个用于枯草芽孢杆菌的非冗余数据库。

NRSub: a non-redundant database for Bacillus subtilis.

作者信息

Perrière G, Moszer I, Gojobori T

机构信息

Laboratoire de Biometrie, Universite Claude Bernard-Lyon, Villeurbanne, France.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):41-5. doi: 10.1093/nar/24.1.41.

DOI:10.1093/nar/24.1.41
PMID:8594597
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC145565/
Abstract

In the context of the international project aimed at sequencing the whole genome of Bacillus subtilis we have developed a non-redundant, fully annotated database of sequences from this organism. Starting from the B.subtilis sequences available in the EMBL, GenBank and DDBJ collections we have removed all encountered duplications and then added extra annotations to the sequences (e.g. accession numbers for the genes, locations on the genetic map, codon usage, etc.) We have also added cross-references to the EMBL, MEDLINE, SWISS-PROT and ENZYME data banks. The present system results from merging of the NRSub and SubtiList databases and the sequence contigs used in the two systems are identical. NRSub is distributed as a flatfile in EMBL format (which is supported by most sequence analysis software packages) and as an ACNUC database, while SubtiList is distributed as a relational database under 4th Dimension. It is possible to access the data through two dedicated World Wide Web servers located in France and Japan.

摘要

在旨在对枯草芽孢杆菌全基因组进行测序的国际项目背景下，我们开发了一个关于该生物体序列的非冗余、全注释数据库。从EMBL、GenBank和DDBJ数据库中可得的枯草芽孢杆菌序列出发，我们去除了所有发现的重复序列，然后为这些序列添加了额外注释（如基因登录号、遗传图谱上的位置、密码子使用情况等）。我们还添加了与EMBL、MEDLINE、SWISS-PROT和ENZYME数据库的交叉引用。当前系统是由NRSub和SubtiList数据库合并而成，两个系统中使用的序列重叠群是相同的。NRSub以EMBL格式的平面文件（大多数序列分析软件包都支持）和ACNUC数据库的形式分发，而SubtiList以关系数据库的形式在4th Dimension下分发。可以通过位于法国和日本的两个专用万维网服务器访问这些数据。