• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

比尔博,果蝇的一种非长末端重复序列反转录转座子:果蝇中类LINE元件进化的线索。

bilbo, a non-LTR retrotransposon of Drosophila subobscura: a clue to the evolution of LINE-like elements in Drosophila.

作者信息

Blesa D, Martínez-Sebastián M J

机构信息

Departamento de Genética, Universidad de Valencia, Spain.

出版信息

Mol Biol Evol. 1997 Nov;14(11):1145-53. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025724.

DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025724
PMID:9364772
Abstract

We used the repetitive character of transposable elements to isolate a non-LTR retrotransposon in Drosophila subobscura. bilbo, as we have called it, has homology to TRIM and LOA elements. Sequence analysis showed a 5' untranslated region (UTR), an open reading frame (ORF) with no RNA-binding domains, a downstream ORF that had structural homology to that of the I factor, and, finally, a 3' UTR which ended in several 5-nt repeats. The results of our phylogenetic and structural analyses shed light on the evolution of Drosophila non-LTR retrotransposons and support the hypothesis that an ancestor of these elements was structurally complex.

摘要

我们利用转座元件的重复特性,在果蝇中分离出一种非长末端重复序列(non-LTR)反转录转座子。我们将其命名为bilbo,它与TRIM和LOA元件具有同源性。序列分析显示,它有一个5'非翻译区(UTR)、一个没有RNA结合结构域的开放阅读框(ORF)、一个与I因子结构同源的下游ORF,最后还有一个以几个5核苷酸重复序列结尾的3'UTR。我们的系统发育和结构分析结果揭示了果蝇非LTR反转录转座子的进化,并支持了这些元件的祖先在结构上很复杂这一假说。

相似文献

1
bilbo, a non-LTR retrotransposon of Drosophila subobscura: a clue to the evolution of LINE-like elements in Drosophila.比尔博,果蝇的一种非长末端重复序列反转录转座子:果蝇中类LINE元件进化的线索。
Mol Biol Evol. 1997 Nov;14(11):1145-53. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025724.
2
The analysis of Circe, an LTR retrotransposon of Drosophila melanogaster, suggests that an insertion of non-LTR retrotransposons into LTR elements can create chimeric retroelements.对黑腹果蝇的LTR反转录转座子Circe的分析表明,非LTR反转录转座子插入LTR元件可产生嵌合反转录元件。
Mol Biol Evol. 1999 Oct;16(10):1341-6. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026044.
3
Distribution of the bilbo non-LTR retrotransposon in Drosophilidae and its evolution in the Drosophila obscura species group.比尔博非长末端重复反转录转座子在果蝇科中的分布及其在果蝇 obscura 物种组中的进化。
Mol Biol Evol. 2001 Apr;18(4):585-92. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003839.
4
Structural, genomic, and phylogenetic analysis of Lian, a novel family of non-LTR retrotransposons in the yellow fever mosquito, Aedes aegypti.对埃及伊蚊(黄热病蚊子)中一个新型非LTR逆转录转座子家族Lian的结构、基因组和系统发育分析。
Mol Biol Evol. 1998 Jul;15(7):837-53. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025989.
5
Structural and phylogenetic analysis of TRAS, telomeric repeat-specific non-LTR retrotransposon families in Lepidopteran insects.鳞翅目昆虫端粒重复序列特异性非长末端重复反转录转座子家族TRAS的结构与系统发育分析
Mol Biol Evol. 2001 May;18(5):848-57. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003866.
6
SR2 elements, non-long terminal repeat retrotransposons of the RTE-1 lineage from the human blood fluke Schistosoma mansoni.SR2元件,来自人类血吸虫曼氏血吸虫的RTE-1谱系的非长末端重复逆转座子。
Mol Biol Evol. 1999 Sep;16(9):1256-69. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026216.
7
CsRn1, a novel active retrotransposon in a parasitic trematode, Clonorchis sinensis, discloses a new phylogenetic clade of Ty3/gypsy-like LTR retrotransposons.华支睾吸虫(中华肝吸虫)中一种新型的活跃逆转录转座子CsRn1,揭示了Ty3/gypsy样长末端重复序列逆转录转座子的一个新系统发育分支。
Mol Biol Evol. 2001 Aug;18(8):1474-83. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003933.
8
Evolutionary patterns of the gypsy and bilbo retrotransposon families in the Drosophila species of the obscura group.果蝇暗果蝇种组中吉普赛和比尔博逆转录转座子家族的进化模式。
Mol Phylogenet Evol. 2002 Nov;25(2):254-66. doi: 10.1016/s1055-7903(02)00257-9.
9
Sequence analysis of transposable elements in the sea squirt, Ciona intestinalis.海鞘(Ciona intestinalis)中转座元件的序列分析。
Mol Biol Evol. 2000 Nov;17(11):1685-94. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026267.
10
A non-LTR retrotransposon from the Hawaiian Drosophila: the LOA element.来自夏威夷果蝇的一种非长末端重复序列逆转座子:LOA元件。
Genetica. 1992;85(2):119-30. doi: 10.1007/BF00120318.

引用本文的文献

1
An insight into the sialome of the horse fly, Tabanus bromius.对虻科昆虫黑角黄虻唾液蛋白质组的深入研究。
Insect Biochem Mol Biol. 2015 Oct;65:83-90. doi: 10.1016/j.ibmb.2015.09.002. Epub 2015 Sep 11.
2
Non-long terminal repeat (non-LTR) retrotransposons: mechanisms, recent developments, and unanswered questions.非长末端重复序列(non-LTR)反转录转座子:机制、最新进展和未解决的问题。
Mob DNA. 2010 May 12;1(1):15. doi: 10.1186/1759-8753-1-15.
3
MGEScan-non-LTR: computational identification and classification of autonomous non-LTR retrotransposons in eukaryotic genomes.
MGEScan-non-LTR:真核生物基因组中自主非 LTR 反转录转座子的计算识别与分类。
Nucleic Acids Res. 2009 Nov;37(21):e143. doi: 10.1093/nar/gkp752.
4
Divergent long-terminal-repeat retrotransposon families in the genome of Paragonimus westermani.卫氏并殖吸虫基因组中不同的长末端重复逆转座子家族。
Korean J Parasitol. 2003 Dec;41(4):221-31. doi: 10.3347/kjp.2003.41.4.221.
5
A search for reverse transcriptase-coding sequences reveals new non-LTR retrotransposons in the genome of Drosophila melanogaster.对逆转录酶编码序列的搜索揭示了黑腹果蝇基因组中的新型非LTR逆转座子。
Genome Biol. 2000;1(6):RESEARCH0012. doi: 10.1186/gb-2000-1-6-research0012. Epub 2000 Dec 4.