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TOPAL：DNA和蛋白质序列中的重组检测

TOPAL: recombination detection in DNA and protein sequences.

作者信息

McGuire G, Wright F

机构信息

Biomathematics and Statistics Scotland, King's Buildings, Edinburgh, UK.

出版信息

Bioinformatics. 1998;14(2):219-20. doi: 10.1093/bioinformatics/14.2.219.

DOI:10.1093/bioinformatics/14.2.219
PMID:9545456
Abstract

UNLABELLED

TOPAL scans a multiple sequence alignment for evidence of recombinant sequences, prior to phylogenetic analysis.

AVAILABILITY

The TOPAL package may be accessed at http://www.bioss.sari.ac.uk/grainne, and by anonymous ftp at ftp.bioss. sari.ac.uk in the directory pub/phylogeny/topal.

CONTACT

grainne@bioss.sari.ac.uk

摘要

未标记

在进行系统发育分析之前，TOPAL会扫描多序列比对以寻找重组序列的证据。

可用性

可通过http://www.bioss.sari.ac.uk/grainne访问TOPAL软件包，也可通过匿名ftp从ftp.bioss.sari.ac.uk的pub/phylogeny/topal目录获取。

联系方式

grainne@bioss.sari.ac.uk

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