• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

SWAN:核苷酸序列变异性的滑动窗口分析

SWAN: sliding window analysis of nucleotide sequence variability.

作者信息

Proutski V, Holmes E

机构信息

The Wellcome Trust Centre for the Epidemiology of Infectious Disease, Department of Zoology, University of Oxford, South Parks Road Oxford OX1 3PS, UK.

出版信息

Bioinformatics. 1998 Jun;14(5):467-8. doi: 10.1093/bioinformatics/14.5.467.

DOI:10.1093/bioinformatics/14.5.467
PMID:9682061
Abstract

RESULTS

This paper describes a new program which reveals, analyses and graphically represents patterns of variability along nucleotide sequences.

AVAILABILITY

The program, 'SWAN', is available from the WWW at http://evolve.zoo.ox.ac.uk/ or from the authors upon request.

CONTACT

Vitali.Proutski@zoology.oxford.ac.uk

摘要

结果

本文描述了一个新程序,该程序可揭示、分析并以图形方式呈现核苷酸序列的变异模式。

可用性

该程序“SWAN”可从万维网http://evolve.zoo.ox.ac.uk/获取,或可应作者要求提供。

联系方式

Vitali.Proutski@zoology.oxford.ac.uk

相似文献

1
SWAN: sliding window analysis of nucleotide sequence variability.SWAN:核苷酸序列变异性的滑动窗口分析
Bioinformatics. 1998 Jun;14(5):467-8. doi: 10.1093/bioinformatics/14.5.467.
2
Protein analyst--a distributed object environment for protein sequence and structure analysis.蛋白质分析器——用于蛋白质序列和结构分析的分布式对象环境。
Bioinformatics. 1999 Jun;15(6):521-2. doi: 10.1093/bioinformatics/15.6.521.
3
VisRD--visual recombination detection.VisRD——视觉重组检测
Bioinformatics. 2004 Dec 12;20(18):3654-5. doi: 10.1093/bioinformatics/bth400. Epub 2004 Jul 9.
4
On the application of integer arithmetic in nucleotide sequence analysis.整数运算在核苷酸序列分析中的应用
Comput Appl Biosci. 1995 Oct;11(5):567-9.
5
GESTALT: a workbench for automatic integration and visualization of large-scale genomic sequence analyses.GESTALT:一个用于大规模基因组序列分析的自动整合与可视化的工作台。
Bioinformatics. 2000 May;16(5):482-3. doi: 10.1093/bioinformatics/16.5.482.
6
BlastAlign: a program that uses blast to align problematic nucleotide sequences.BlastAlign:一个使用Blast来比对有问题的核苷酸序列的程序。
Bioinformatics. 2005 Jan 1;21(1):122-3. doi: 10.1093/bioinformatics/bth459. Epub 2004 Aug 13.
7
Detecting periodic patterns in biological sequences.检测生物序列中的周期性模式。
Bioinformatics. 1998;14(6):498-507. doi: 10.1093/bioinformatics/14.6.498.
8
Integrated tools for structural and sequence alignment and analysis.用于结构和序列比对及分析的集成工具。
Pac Symp Biocomput. 2000:230-41. doi: 10.1142/9789814447331_0022.
9
CLEANUP: a fast computer program for removing redundancies from nucleotide sequence databases.清理程序(CLEANUP):一款用于去除核苷酸序列数据库冗余信息的快速计算机程序。
Comput Appl Biosci. 1996 Feb;12(1):1-8. doi: 10.1093/bioinformatics/12.1.1.
10
DCA: an efficient implementation of the divide-and-conquer approach to simultaneous multiple sequence alignment.DCA:一种用于同时进行多序列比对的分治方法的高效实现。
Comput Appl Biosci. 1997 Dec;13(6):625-6. doi: 10.1093/bioinformatics/13.6.625.

引用本文的文献

1
The Fast Evolution of the Stenobothrini Grasshoppers (Orthoptera, Acrididae, and Gomphocerinae) Revealed by an Analysis of the Control Region of mtDNA, with an Emphasis on the Group.通过对线粒体DNA控制区的分析揭示的窄翅蝗属蝗虫(直翅目,蝗科, gomphocerinae亚科)的快速进化,重点关注该类群。
Insects. 2024 Aug 3;15(8):592. doi: 10.3390/insects15080592.
2
HyPep: An Open-Source Software for Identification and Discovery of Neuropeptides Using Sequence Homology Search.HyPep:一种使用序列同源搜索鉴定和发现神经肽的开源软件。
J Proteome Res. 2023 Feb 3;22(2):420-431. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00597. Epub 2023 Jan 25.
3
Contribution of RNA-RNA Interactions Mediated by the Genome Packaging Signals for the Selective Genome Packaging of Influenza A Virus.
基因组包装信号介导的 RNA-RNA 相互作用对甲型流感病毒选择性基因组包装的贡献。
J Virol. 2022 Mar 23;96(6):e0164121. doi: 10.1128/JVI.01641-21. Epub 2022 Jan 19.
4
Comparative Analysis for Genetic Characterization in Korean Native Jeju Horse.韩国本土济州马遗传特征的比较分析
Animals (Basel). 2021 Jun 28;11(7):1924. doi: 10.3390/ani11071924.
5
New 12S metabarcoding primers for enhanced Neotropical freshwater fish biodiversity assessment.新型 12S 代谢组条形码引物可提高新热带淡水鱼生物多样性评估效果。
Sci Rep. 2020 Oct 21;10(1):17966. doi: 10.1038/s41598-020-74902-3.
6
The design and testing of mini-barcode markers in marine lobsters.海洋龙虾微型条码标记的设计与测试。
PLoS One. 2019 Jan 24;14(1):e0210492. doi: 10.1371/journal.pone.0210492. eCollection 2019.
7
Genome-wide analysis of influenza viral RNA and nucleoprotein association.流感病毒RNA与核蛋白关联的全基因组分析。
Nucleic Acids Res. 2017 Sep 6;45(15):8968-8977. doi: 10.1093/nar/gkx584.
8
Frequency matrix approach demonstrates high sequence quality in avian BARCODEs and highlights cryptic pseudogenes.频率矩阵方法可证明鸟类 BARCODE 具有较高的序列质量,并突出显示隐匿假基因。
PLoS One. 2012;7(8):e43992. doi: 10.1371/journal.pone.0043992. Epub 2012 Aug 27.
9
Maximum-likelihood model averaging to profile clustering of site types across discrete linear sequences.用于跨离散线性序列的位点类型轮廓聚类的最大似然模型平均法。
PLoS Comput Biol. 2009 Jun;5(6):e1000421. doi: 10.1371/journal.pcbi.1000421. Epub 2009 Jun 26.
10
The complete mitochondrial genomes of two band-winged grasshoppers, Gastrimargus marmoratus and Oedaleus asiaticus.两种斑翅蝗科蝗虫,棉蝗和亚洲小车蝗的完整线粒体基因组。
BMC Genomics. 2009 Apr 10;10:156. doi: 10.1186/1471-2164-10-156.