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矩阵图:可视化序列约束

MatrixPlot: visualizing sequence constraints.

作者信息

Gorodkin J, Staerfeldt H H, Lund O, Brunak S

机构信息

Center for Biological Sequence Analysis, Department of Biotechnology, The Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark.

出版信息

Bioinformatics. 1999 Sep;15(9):769-70. doi: 10.1093/bioinformatics/15.9.769.

DOI:10.1093/bioinformatics/15.9.769
PMID:10498780
Abstract

UNLABELLED

MatrixPlot is a program for making high-quality matrix plots, such as mutual information plots of sequence alignments and distance matrices of sequences with known three-dimensional coordinates. The user can add information about the sequences (e.g. a sequence logo profile) along the edges of the plot, as well as zoom in on any region in the plot.

AVAILABILITY

MatrixPlot can be obtained on request, and can also be accessed online at http://www. cbs.dtu.dk/services/MatrixPlot.

CONTACT

gorodkin@cbs.dtu.dk

摘要

未标记

MatrixPlot是一个用于制作高质量矩阵图的程序,例如序列比对的互信息图和具有已知三维坐标的序列的距离矩阵。用户可以沿着图的边缘添加有关序列的信息(例如序列标志轮廓),还可以放大图中的任何区域。

可用性

可根据请求获取MatrixPlot,也可以通过在线访问http://www.cbs.dtu.dk/services/MatrixPlot获得。

联系方式

gorodkin@cbs.dtu.dk

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