• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

化学信息学——化学文库中的相似性与多样性

Chemoinformatics - similarity and diversity in chemical libraries.

作者信息

Willett P

机构信息

Department of Information Studies, University of Sheffield, Sheffield, S10 2TN, UK.

出版信息

Curr Opin Biotechnol. 2000 Feb;11(1):85-8. doi: 10.1016/s0958-1669(99)00059-2.

DOI:10.1016/s0958-1669(99)00059-2
PMID:10679335
Abstract

Molecular similarity and molecular diversity techniques lie at the heart of attempts to design structurally diverse combinatorial libraries for the identification of novel bioactive compounds. Recent advances include the development of new types of selection algorithm, the validation of such algorithms, the use of filtering systems to screen out undesirable molecules prior to the design of a library, and the integration of similarity and diversity analysis with other methods for computer-aided molecular design.

摘要

分子相似性和分子多样性技术是设计结构多样的组合文库以鉴定新型生物活性化合物的核心方法。近期进展包括新型选择算法的开发、此类算法的验证、在文库设计前使用过滤系统筛选出不良分子,以及将相似性和多样性分析与其他计算机辅助分子设计方法相结合。

相似文献

1
Chemoinformatics - similarity and diversity in chemical libraries.化学信息学——化学文库中的相似性与多样性
Curr Opin Biotechnol. 2000 Feb;11(1):85-8. doi: 10.1016/s0958-1669(99)00059-2.
2
Molecular similarity and diversity in chemoinformatics: from theory to applications.化学信息学中的分子相似性与多样性:从理论到应用
Mol Divers. 2006 Feb;10(1):39-79. doi: 10.1007/s11030-006-8697-1.
3
Molecular descriptors in chemoinformatics, computational combinatorial chemistry, and virtual screening.化学信息学、计算组合化学和虚拟筛选中的分子描述符。
Comb Chem High Throughput Screen. 2000 Oct;3(5):363-72. doi: 10.2174/1386207003331454.
4
Novel algorithms for the optimization of molecular diversity of combinatorial libraries.用于优化组合文库分子多样性的新型算法。
J Mol Graph Model. 2000 Aug-Oct;18(4-5):412-26, 533-6. doi: 10.1016/s1093-3263(00)00071-1.
5
Extraction of pharmacophore information from high-throughput screens.从高通量筛选中提取药效团信息。
Curr Opin Biotechnol. 2000 Feb;11(1):97-103. doi: 10.1016/s0958-1669(99)00061-0.
6
Combinatorial library design for diversity, cost efficiency, and drug-like character.用于多样性、成本效益和类药物特性的组合文库设计。
J Mol Graph Model. 2000 Aug-Oct;18(4-5):427-37, 537. doi: 10.1016/s1093-3263(00)00072-3.
7
Use of mathematical structural invariants in analyzing combinatorial libraries: a case study with psoralen derivatives.数学结构不变量在组合文库分析中的应用:补骨脂素衍生物的案例研究
Curr Comput Aided Drug Des. 2010 Dec;6(4):240-51. doi: 10.2174/1573409911006040240.
8
Computational techniques for diversity analysis and compound classification.用于多样性分析和化合物分类的计算技术。
Mini Rev Med Chem. 2004 Dec;4(10):1029-39. doi: 10.2174/1389557043402982.
9
Synthetic library design.合成文库设计。
Drug Discov Today. 2006 Aug;11(15-16):763-7. doi: 10.1016/j.drudis.2006.06.017.
10
LoFT: similarity-driven multiobjective focused library design.LoFT:基于相似度的多目标聚焦库设计。
J Chem Inf Model. 2010 Jan;50(1):1-21. doi: 10.1021/ci900287p.

引用本文的文献

1
Dissimilar Ligands Bind in a Similar Fashion: A Guide to Ligand Binding-Mode Prediction with Application to CELPP Studies.不同配体以相似的方式结合:一种用于预测配体结合模式的指南,及其在 CELPP 研究中的应用。
Int J Mol Sci. 2021 Nov 15;22(22):12320. doi: 10.3390/ijms222212320.
2
Calculating Glycoprotein Similarities From Mass Spectrometric Data.计算质谱数据中的糖蛋白相似度。
Mol Cell Proteomics. 2021;20:100028. doi: 10.1074/mcp.R120.002223. Epub 2021 Jan 6.
3
Chemoinformatics: a perspective from an academic setting in Latin America.
化学生物信息学:来自拉丁美洲学术背景的观点。
Mol Divers. 2018 Feb;22(1):247-258. doi: 10.1007/s11030-017-9802-3. Epub 2017 Dec 4.
4
Consensus Diversity Plots: a global diversity analysis of chemical libraries.共识多样性图:化学文库的全球多样性分析。
J Cheminform. 2016 Nov 10;8:63. doi: 10.1186/s13321-016-0176-9. eCollection 2016.
5
Landscape of protein-small ligand binding modes.蛋白质-小分子配体结合模式全景图。
Protein Sci. 2016 Sep;25(9):1659-71. doi: 10.1002/pro.2971. Epub 2016 Jul 4.
6
Exploration of Scaffolds from Natural Products with Antiplasmodial Activities, Currently Registered Antimalarial Drugs and Public Malarial Screen Data.探索具有抗疟活性的天然产物支架、目前已注册的抗疟药物及公共疟疾筛查数据。
Molecules. 2016 Jan 16;21(1):104. doi: 10.3390/molecules21010104.
7
Biasing Potential Replica Exchange Multisite λ-Dynamics for Efficient Free Energy Calculations.用于高效自由能计算的偏置势副本交换多位点λ动力学
J Chem Theory Comput. 2015 Mar 10;11(3):1267-77. doi: 10.1021/ct500894k.
8
PubChem atom environments.美国国立医学图书馆化学数据库(PubChem)的原子环境
J Cheminform. 2015 Aug 19;7:41. doi: 10.1186/s13321-015-0076-4. eCollection 2015.
9
Unveiling new biological relationships using shared hits of chemical screening assay pairs.利用化学筛选分析对的共享命中结果揭示新的生物学关系。
Bioinformatics. 2014 Sep 1;30(17):i579-86. doi: 10.1093/bioinformatics/btu468.
10
ClusterMine360: a database of microbial PKS/NRPS biosynthesis.ClusterMine360:一个微生物 PKS/NRPS 生物合成数据库。
Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(Database issue):D402-7. doi: 10.1093/nar/gks993. Epub 2012 Oct 26.