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DomCut：氨基酸序列中结构域间连接区的预测

DomCut: prediction of inter-domain linker regions in amino acid sequences.

作者信息

Suyama Mikita, Ohara Osamu

机构信息

Laboratory of DNA Technology, Kazusa DNA Research Institute, 1532-3 Yana, Kisarazu, Chiba 292-0812, Japan.

出版信息

Bioinformatics. 2003 Mar 22;19(5):673-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btg031.

DOI:10.1093/bioinformatics/btg031
PMID:12651735
Abstract

DomCut is a program to predict inter-domain linker regions solely by amino acid sequence information. The prediction is made by using linker index deduced from a data set of domain/linker segments. The linker preference profile, which is the averaged linker index along a sequence, can be visualized in the graphical interface.

摘要

DomCut是一个仅通过氨基酸序列信息来预测结构域间连接区的程序。该预测是通过使用从结构域/连接区片段数据集推导得出的连接指数来进行的。连接偏好图谱，即沿序列的平均连接指数，可以在图形界面中可视化。

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