PfamAlyzer：以结构域为中心的同源性搜索。
PfamAlyzer: domain-centric homology search.
作者信息
Hollich Volker, Sonnhammer Erik L L
机构信息
Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, S-171 77 Stockholm, Sweden.
出版信息
Bioinformatics. 2007 Dec 15;23(24):3382-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm521. Epub 2007 Oct 31.
UNLABELLED
PfamAlyzer is a Java applet that enables exploration of Pfam domain architectures using a user-friendly graphical interface. It can search the UniProt protein database for a domain pattern. Domain patterns similar to the query are presented graphically by PfamAlyzer either in a ranked list or pinned to the tree of life. Such domain-centric homology search can assist identification of distant homologs with shared domain architecture.
AVAILABILITY
PfamAlyzer has been integrated with the Pfam database and can be accessed at http://pfam.cgb.ki.se/pfamalyzer.
未标记
PfamAlyzer是一个Java小程序，它能够使用用户友好的图形界面来探索Pfam结构域架构。它可以在UniProt蛋白质数据库中搜索结构域模式。PfamAlyzer会以图形方式在排序列表中或固定到生命树中呈现与查询相似的结构域模式。这种以结构域为中心的同源性搜索有助于识别具有共享结构域架构的远缘同源物。
可用性
PfamAlyzer已与Pfam数据库集成，可通过http://pfam.cgb.ki.se/pfamalyzer访问。
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