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RankGene:基于表达数据的诊断基因鉴定

RankGene: identification of diagnostic genes based on expression data.

作者信息

Su Yang, Murali T M, Pavlovic Vladimir, Schaffer Michael, Kasif Simon

机构信息

Bioinformatics Program, Boston University, Boston, MA 02215, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2003 Aug 12;19(12):1578-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btg179.

Abstract

RankGene is a program for analyzing gene expression data and computing diagnostic genes based on their predictive power in distinguishing between different types of samples. The program integrates into one system a variety of popular ranking criteria, ranging from the traditional t-statistic to one-dimensional support vector machines. This flexibility makes RankGene a useful tool in gene expression analysis and feature selection.

摘要

RankGene是一个用于分析基因表达数据并根据其在区分不同类型样本中的预测能力来计算诊断基因的程序。该程序将从传统的t统计量到一维支持向量机等各种流行的排名标准集成到一个系统中。这种灵活性使RankGene成为基因表达分析和特征选择中的一个有用工具。

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