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通过共表达镧系元素结合标签进行蛋白质比对以测量剩余偶极耦合。

Protein alignment by a coexpressed lanthanide-binding tag for the measurement of residual dipolar couplings.

作者信息

Wöhnert Jens, Franz Katherine J, Nitz Mark, Imperiali Barbara, Schwalbe Harald

机构信息

Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie, Center for Biomolecular Magnetic Resonance, Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt, Marie-Curie-Strasse 11, 60439 Frankfurt/M, Germany.

出版信息

J Am Chem Soc. 2003 Nov 5;125(44):13338-9. doi: 10.1021/ja036022d.

DOI:10.1021/ja036022d
PMID:14583012
Abstract

A protein fusion construct of human ubiquitin with an N-terminal lanthanide binding tag (LBT) enables observation of long-range orientational restraints in solution NMR from residual dipolar couplings (RDCs) due to paramagnetic alignment of the protein. The paramagnetic lanthanide ions Tb3+, Dy3+, and Tm3+ are shown to bind to the LBT and induce different alignment tensors, in agreement with theory. RDCs, measured relative to the diamagnetic Lu3+, range from -7.6 to 5.5 Hz for Tb3+ and -6.6 to 6.1 Hz for Dy3+, while an opposite alignment tensor is observed for Tm3+ (4.5 to -2.9 Hz) at 800 MHz. Experimental RDCs are in excellent agreement with those predicted on the basis of the X-ray structure of the protein.

摘要

一种将人泛素与N端镧系元素结合标签(LBT)融合的蛋白质构建体,能够通过蛋白质顺磁排列产生的残余偶极耦合(RDC),在溶液核磁共振中观察到长程取向限制。顺磁镧系离子Tb3 +、Dy3 +和Tm3 +显示与LBT结合并诱导不同的排列张量,这与理论相符。相对于抗磁的Lu3 +测量的RDC,对于Tb3 +范围为-7.6至5.5 Hz,对于Dy3 +范围为-6.6至6.1 Hz,而在800 MHz下观察到Tm3 +的排列张量相反(4.5至-2.9 Hz)。实验得到的RDC与基于蛋白质X射线结构预测的结果高度吻合。

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