• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一项使用EVA描述符和层次聚类的结构-气味关系研究。

A structure-odour relationship study using EVA descriptors and hierarchical clustering.

作者信息

Takane Shin-ya, Mitchell John B O

机构信息

Unilever Centre for Molecular Science Informatics, Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge CB2 1EW, UK.

出版信息

Org Biomol Chem. 2004 Nov 21;2(22):3250-5. doi: 10.1039/B409802A. Epub 2004 Sep 28.

DOI:10.1039/B409802A
PMID:15534702
Abstract

Structure-odour relationship analyses using hierarchical clustering were carried out on a diverse dataset of 47 molecules. These molecules were divided into seven odour categories: ambergris, bitter almond, camphoraceous, rose, jasmine, muguet, and musk. The alignment-independent descriptor EVA (EigenVAlue) was used as the molecular descriptor. The results were compared with those of another kind of descriptor, the UNITY 2D fingerprint. The dendrograms obtained with these descriptors were compared with the seven odour categories using the adjusted Rand index. The dendrograms produced by EVA consistently outperformed those from UNITY 2D in reproducing the experimental odour classifications of these 47 molecules.

摘要

使用层次聚类对47种分子的不同数据集进行了结构-气味关系分析。这些分子被分为七个气味类别:龙涎香、苦杏仁、樟脑味、玫瑰、茉莉、铃兰和麝香。与分子结构无关的描述符EVA(特征值)被用作分子描述符。将结果与另一种描述符——UNITY 2D指纹的结果进行了比较。使用调整后的兰德指数将用这些描述符获得的树状图与七个气味类别进行了比较。在重现这47种分子的实验气味分类方面,由EVA生成的树状图始终优于来自UNITY 2D的树状图。

相似文献

1
A structure-odour relationship study using EVA descriptors and hierarchical clustering.一项使用EVA描述符和层次聚类的结构-气味关系研究。
Org Biomol Chem. 2004 Nov 21;2(22):3250-5. doi: 10.1039/B409802A. Epub 2004 Sep 28.
2
Combinatorial QSAR of ambergris fragrance compounds.龙涎香香料化合物的组合定量构效关系
J Chem Inf Comput Sci. 2004 Mar-Apr;44(2):582-95. doi: 10.1021/ci034203t.
3
QSAR modeling of datasets with enantioselective compounds using chirality sensitive molecular descriptors.使用手性敏感分子描述符对含对映体选择性化合物的数据集进行定量构效关系建模。
SAR QSAR Environ Res. 2005 Feb-Apr;16(1-2):93-102. doi: 10.1080/10629360412331319844.
4
Adapting the structure of a neural network to extract chemical information. Application to structure-odour relationships.调整神经网络结构以提取化学信息。在结构-气味关系中的应用。
SAR QSAR Environ Res. 1993;1(2-3):221-31. doi: 10.1080/10629369308028830.
5
A new electronic-topological investigation of the relationship between chemical structure and ambergris odour.关于化学结构与龙涎香气味之间关系的一项新的电子拓扑学研究。
Chem Senses. 1999 Apr;24(2):171-8. doi: 10.1093/chemse/24.2.171.
6
Recent results in the search for new molecules with ambergris odor.
Chem Biodivers. 2014 Oct;11(10):1639-50. doi: 10.1002/cbdv.201400153.
7
Molecular Descriptors for Structure-Activity Applications: A Hands-On Approach.用于构效关系应用的分子描述符:实践方法。
Methods Mol Biol. 2018;1800:3-53. doi: 10.1007/978-1-4939-7899-1_1.
8
An evaluation of structural descriptors and clustering methods for use in diversity selection.用于多样性选择的结构描述符和聚类方法的评估。
SAR QSAR Environ Res. 1998;8(1-2):23-39. doi: 10.1080/10629369808033260.
9
How frequently do clusters occur in hierarchical clustering analysis? A graph theoretical approach to studying ties in proximity.在层次聚类分析中,簇出现的频率如何?一种研究邻近关系中联系的图论方法。
J Cheminform. 2016 Jan 25;8:4. doi: 10.1186/s13321-016-0114-x. eCollection 2016.
10
Structure-odour relationships: results of an applied electron-topological approach.结构-气味关系:一种应用电子拓扑学方法的结果
Nahrung. 1998 Dec;42(6):364-70. doi: 10.1002/(sici)1521-3803(199812)42:06<364::aid-food364>3.3.co;2-e.

引用本文的文献

1
Vibration-based biomimetic odor classification.基于振动的仿生气味分类。
Sci Rep. 2021 May 31;11(1):11389. doi: 10.1038/s41598-021-90592-x.
2
Chemical features mining provides new descriptive structure-odor relationships.化学特征挖掘提供了新的描述性结构-气味关系。
PLoS Comput Biol. 2019 Apr 25;15(4):e1006945. doi: 10.1371/journal.pcbi.1006945. eCollection 2019 Apr.
3
Neuroreceptor activation by vibration-assisted tunneling.通过振动辅助隧穿实现神经受体激活。
Sci Rep. 2015 Apr 24;5:9990. doi: 10.1038/srep09990.
4
Implausibility of the vibrational theory of olfaction.嗅觉振动理论的不可信性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 May 26;112(21):E2766-74. doi: 10.1073/pnas.1503054112. Epub 2015 Apr 21.
5
Molecular vibration-activity relationship in the agonism of adenosine receptors.腺苷受体激动作用中的分子振动-活性关系
Genomics Inform. 2013 Dec;11(4):282-8. doi: 10.5808/GI.2013.11.4.282. Epub 2013 Dec 31.
6
The Potential of 13C Isotopomers as a Test for the Vibrational Theory of Olfactory Sense Recognition.13C 同位素异构体作为嗅觉识别振动理论测试的潜力
ISRN Org Chem. 2013 May 26;2013:515810. doi: 10.1155/2013/515810. eCollection 2013.
7
Molecular vibration-sensing component in human olfaction.人类嗅觉中的分子振动感应元件。
PLoS One. 2013;8(1):e55780. doi: 10.1371/journal.pone.0055780. Epub 2013 Jan 25.
8
Characteristics in Molecular Vibrational Frequency Patterns between Agonists and Antagonists of Histamine Receptors.组胺受体激动剂与拮抗剂分子振动频率模式的特征
Genomics Inform. 2012 Jun;10(2):128-32. doi: 10.5808/GI.2012.10.2.128. Epub 2012 Jun 30.
9
Application of 3D Zernike descriptors to shape-based ligand similarity searching.三维 Zernike 描述子在基于形状的配体相似性搜索中的应用。
J Cheminform. 2009 Dec 17;1:19. doi: 10.1186/1758-2946-1-19.