Suppr超能文献

ORIOGEN:有序基因表达数据的顺序受限推断

ORIOGEN: order restricted inference for ordered gene expression data.

作者信息

Peddada S, Harris S, Zajd J, Harvey E

机构信息

Biostatistics Branch, National Institute of Environmental Health Sciences, Durham, NC 27713, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2005 Oct 15;21(20):3933-4. doi: 10.1093/bioinformatics/bti637. Epub 2005 Aug 18.

Abstract

UNLABELLED

ORIOGEN is a user-friendly Java-based software package for selecting and clustering genes according to their profiles across various treatment groups. In particular, ORIOGEN is useful for analyzing data obtained from time-course or dose-response type experiments.

AVAILABILITY

The ORIOGEN software can be downloaded freely from http://dir.niehs.nih.gov/dirbb/oriogen/index.cfm

CONTACT

peddada@niehs.nih.gov (for statistical questions) and oriogen@constellagroup.com (for software support)

SUPPLEMENTARY INFORMATION

ORIOGEN has a full set of help files. Also, an example input file is provided with the download.

摘要

未标注

ORIOGEN是一个基于Java的用户友好型软件包,用于根据基因在不同治疗组中的表达谱进行选择和聚类。特别是,ORIOGEN对于分析从时间进程或剂量反应类型实验中获得的数据很有用。

可用性

ORIOGEN软件可从http://dir.niehs.nih.gov/dirbb/oriogen/index.cfm免费下载。

联系方式

peddada@niehs.nih.gov(用于统计问题)和oriogen@constellagroup.com(用于软件支持)

补充信息

ORIOGEN有一整套帮助文件。此外,下载时还提供了一个示例输入文件。

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