• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

用化学振荡器切换DNA分子的构象。

Switching the conformation of a DNA molecule with a chemical oscillator.

作者信息

Liedl Tim, Simmel Friedrich C

机构信息

Department of Physics and Center for Nanoscience, Ludwig-Maximilians-Universität München, Geschwister-Scholl-Platz 1, 80539 Münich, Germany.

出版信息

Nano Lett. 2005 Oct;5(10):1894-8. doi: 10.1021/nl051180j.

DOI:10.1021/nl051180j
PMID:16218705
Abstract

pH oscillations generated by a nonequilibrium chemical reaction are used to switch a pH-sensitive DNA structure between two distinct conformations. The utilization of a chemical oscillator represents a novel method for achieving autonomous motion in molecular devices. The oscillatory reaction is a variant of the Landolt reaction and produces pH variations in the range between pH 5 and 7. In this range, a cytosine-rich DNA strand can be switched between a random coil conformation and the folded i-motif structure. The conformational changes are monitored simultaneously with the pH value in fluorescence-resonance energy-transfer experiments.

摘要

由非平衡化学反应产生的pH振荡用于在两种不同构象之间切换pH敏感的DNA结构。利用化学振荡器代表了一种在分子装置中实现自主运动的新方法。振荡反应是Landolt反应的一种变体,产生pH值在5至7之间的变化。在此范围内,富含胞嘧啶的DNA链可以在无规卷曲构象和折叠的i-基序结构之间切换。在荧光共振能量转移实验中,构象变化与pH值同时进行监测。

相似文献

1
Switching the conformation of a DNA molecule with a chemical oscillator.用化学振荡器切换DNA分子的构象。
Nano Lett. 2005 Oct;5(10):1894-8. doi: 10.1021/nl051180j.
2
Monitoring of pH Using an i-Motif-Forming Sequence Containing a Fluorescent Cytosine Analogue, tC.使用含有荧光胞嘧啶类似物 tC 的 i-Motif 形成序列监测 pH 值。
Molecules. 2019 Mar 8;24(5):952. doi: 10.3390/molecules24050952.
3
Deciphering the Nanoconfinement Effect on the Folding Pathway of Promoter-Based Intercalated-Motif DNA by Single-Molecule Förster Resonance Energy Transfer.通过单分子Förster共振能量转移解析纳米限域效应 对基于启动子的插入基序DNA折叠途径的影响
J Phys Chem Lett. 2022 Sep 1;13(34):8169-8176. doi: 10.1021/acs.jpclett.2c01893. Epub 2022 Aug 25.
4
Oscillatory Reaction Induced Periodic C-Quadruplex DNA Gating of Artificial Ion Channels.振荡反应诱导的人工离子通道周期性 C-四链体 DNA 门控。
ACS Nano. 2017 Mar 28;11(3):3022-3029. doi: 10.1021/acsnano.6b08727. Epub 2017 Feb 27.
5
The dynamic properties of an intramolecular transition from DNA duplex to cytosine-thymine motif triplex.从DNA双链体到胞嘧啶 - 胸腺嘧啶基序三链体的分子内转变的动力学特性。
Org Biomol Chem. 2005 Feb 21;3(4):575-7. doi: 10.1039/b418353n. Epub 2005 Jan 5.
6
Charge evolution during the unfolding of a single DNA i-motif.单个DNA i-基序解折叠过程中的电荷演化
Phys Chem Chem Phys. 2018 Jan 3;20(2):916-924. doi: 10.1039/c7cp06235d.
7
Structural polymorphism of a cytosine-rich DNA sequence forming i-motif structure: Exploring pH based biosensors.富含胞嘧啶的 DNA 序列形成 i- 发夹结构的结构多态性:探索基于 pH 的生物传感器。
Int J Biol Macromol. 2018 May;111:455-461. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2018.01.053. Epub 2018 Jan 10.
8
pH-induced intramolecular folding dynamics of i-motif DNA.pH 诱导的 i- -motif DNA 分子内折叠动力学。
J Am Chem Soc. 2011 Oct 12;133(40):16146-53. doi: 10.1021/ja2061984. Epub 2011 Sep 15.
9
Single-molecule analysis of i-motif within self-assembled DNA duplexes and nanocircles.单分子分析发夹结构 DNA 双链体和纳米环中的 i-motif。
Nucleic Acids Res. 2019 Aug 22;47(14):7199-7212. doi: 10.1093/nar/gkz565.
10
Stabilization of i-motif structures by 2'-β-fluorination of DNA.通过DNA的2'-β-氟化作用实现i-基序结构的稳定化。
Nucleic Acids Res. 2016 Jun 20;44(11):4998-5009. doi: 10.1093/nar/gkw402. Epub 2016 May 10.

引用本文的文献

1
Functional Nucleic-Acid-Decorated Spherical Nanoparticles: Preparation Strategies and Current Applications in Cancer Therapy.功能核酸修饰的球形纳米颗粒:制备策略及其在癌症治疗中的当前应用
Small Sci. 2021 Feb 9;1(3):2000056. doi: 10.1002/smsc.202000056. eCollection 2021 Mar.
2
The motive forces in DNA-enabled nanomachinery.基于DNA的纳米机器中的驱动力。
iScience. 2024 Mar 8;27(4):109453. doi: 10.1016/j.isci.2024.109453. eCollection 2024 Apr 19.
3
Recent Advances in DNA Nanomaterials.DNA纳米材料的最新进展
Nanomaterials (Basel). 2023 Aug 29;13(17):2449. doi: 10.3390/nano13172449.
4
A single molecule investigation of i-motif stability, folding intermediates, and potential as pH sensor.对i-基序的稳定性、折叠中间体及其作为pH传感器潜力的单分子研究。
Front Mol Biosci. 2022 Aug 22;9:977113. doi: 10.3389/fmolb.2022.977113. eCollection 2022.
5
Modulation of spatiotemporal dynamics in the bromate-sulfite-ferrocyanide reaction system by visible light.可见光对溴酸盐 - 亚硫酸盐 - 亚铁氰化物反应体系时空动力学的调制
RSC Adv. 2022 May 18;12(24):15145-15149. doi: 10.1039/d2ra01422j. eCollection 2022 May 17.
6
Dissipative DNA nanotechnology.耗散 DNA 纳米技术。
Nat Chem. 2022 Jun;14(6):600-613. doi: 10.1038/s41557-022-00957-6. Epub 2022 Jun 6.
7
Homoduplex to i-motif structural switch exhibited by a cytosine rich strand of the heavy chain β gene promoter at physiological pH.在生理pH值下,重链β基因启动子富含胞嘧啶的链所展现的同型双链到i-基序结构转换。
RSC Adv. 2018 Oct 4;8(60):34202-34214. doi: 10.1039/c8ra05179h.
8
The parallel-stranded d(CGA) duplex is a highly predictable structural motif with two conformationally distinct strands.平行股的 d(CGA)双链是一种具有两种构象上明显不同链的高度可预测的结构基序。
Acta Crystallogr D Struct Biol. 2022 Mar 1;78(Pt 3):299-309. doi: 10.1107/S2059798322000304. Epub 2022 Feb 18.
9
Dissipative operation of pH-responsive DNA-based nanodevices.基于pH响应性DNA的纳米器件的耗散操作。
Chem Sci. 2021 Jul 19;12(35):11735-11739. doi: 10.1039/d1sc03435a. eCollection 2021 Sep 15.
10
Engineering G-quadruplex aptamer to modulate its binding specificity.工程化G-四链体适体以调节其结合特异性。
Natl Sci Rev. 2020 Aug 31;8(4):nwaa202. doi: 10.1093/nsr/nwaa202. eCollection 2021 Apr.