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5S核糖体RNA和5S核糖体RNA基因序列的汇编

Compilation of 5S rRNA and 5S rRNA gene sequences.

作者信息

Specht T, Wolters J, Erdmann V A

机构信息

Institut für Biochemie, Freie Universität Berlin, FRG.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1990 Apr 25;18 Suppl(Suppl):2215-30. doi: 10.1093/nar/18.suppl.2215.

DOI:10.1093/nar/18.suppl.2215
PMID:1692116
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC331873/
Abstract

The BERLIN RNA DATABANK as of December 31, 1989, contains a total of 667 sequences of 5S rRNAs or their genes, which is an increase of 114 new sequence entries over the last compilation (1). It covers sequences from 44 archaebacteria, 267 eubacteria, 20 plastids, 6 mitochondria, 319 eukaryotes and 11 eukaryotic pseudogenes. The hardcopy shows only the list of those organisms whose sequences have been determined. The BERLIN RNA DATABANK uses the format of the EMBL Nucleotide Sequence Data Library complemented by a Sequence Alignment (SA) field including secondary structure information.

摘要

截至1989年12月31日的柏林RNA数据库共包含667个5S核糖体RNA或其基因的序列,比上次汇编(1)新增了114个序列条目。它涵盖了来自44种古细菌、267种真细菌、20种质体、6种线粒体、319种真核生物和11种真核假基因的序列。硬拷贝仅显示其序列已被测定的那些生物的列表。柏林RNA数据库采用EMBL核苷酸序列数据库的格式,并辅以一个包含二级结构信息的序列比对(SA)字段。

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