• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于系统分子碎片化的电子能量的准确性和效率

Accuracy and efficiency of electronic energies from systematic molecular fragmentation.

作者信息

Collins Michael A, Deev Vitali A

机构信息

Research School of Chemistry, Australian National University, Canberra ACT 0200, Australia.

出版信息

J Chem Phys. 2006 Sep 14;125(10):104104. doi: 10.1063/1.2347710.

DOI:10.1063/1.2347710
PMID:16999512
Abstract

A systematic method for approximating the ab initio electronic energy of molecules from the energies of molecular fragments is tested on a large sample of typical organic molecular structures. The detailed methods, including some additional refinements for molecular rings and long range interactions, are described. The accuracy and computational efficiency of the systematic hierarchy of methods are reported.

摘要

一种从分子片段能量近似计算分子从头算电子能量的系统方法,在大量典型有机分子结构样本上进行了测试。文中描述了详细方法,包括对分子环和长程相互作用的一些额外改进。报告了该系统方法层次结构的准确性和计算效率。

相似文献

1
Accuracy and efficiency of electronic energies from systematic molecular fragmentation.基于系统分子碎片化的电子能量的准确性和效率
J Chem Phys. 2006 Sep 14;125(10):104104. doi: 10.1063/1.2347710.
2
Approximate ab initio energies by systematic molecular fragmentation.通过系统的分子片段化近似从头算能量。
J Chem Phys. 2005 Apr 15;122(15):154102. doi: 10.1063/1.1879792.
3
Ab initio energies of nonconducting crystals by systematic fragmentation.通过系统碎片化计算非导电晶体的从头算能量。
J Chem Phys. 2007 Oct 7;127(13):134113. doi: 10.1063/1.2768534.
4
Systematic fragmentation method and the effective fragment potential: an efficient method for capturing molecular energies.系统碎裂方法和有效碎片势:一种捕获分子能量的有效方法。
J Phys Chem A. 2009 Sep 17;113(37):10040-9. doi: 10.1021/jp9036183.
5
Molecular potential energy surfaces constructed from interpolation of systematic fragment surfaces.通过系统片段表面插值构建的分子势能面。
J Chem Phys. 2007 Jul 14;127(2):024104. doi: 10.1063/1.2746025.
6
The combined fragmentation and systematic molecular fragmentation methods.联合碎片化和系统分子碎片化方法。
Acc Chem Res. 2014 Sep 16;47(9):2776-85. doi: 10.1021/ar500088d. Epub 2014 Jun 27.
7
Ab initio lattice dynamics of nonconducting crystals by systematic fragmentation.通过系统分裂进行非导体晶体的从头晶格动力学研究。
J Chem Phys. 2011 Apr 28;134(16):164110. doi: 10.1063/1.3581845.
8
Accurate methods for large molecular systems.适用于大分子系统的精确方法。
J Phys Chem B. 2009 Jul 23;113(29):9646-63. doi: 10.1021/jp811519x.
9
Local CC2 electronic excitation energies for large molecules with density fitting.采用密度拟合计算大分子的局域CC2电子激发能。
J Chem Phys. 2006 Sep 14;125(10):104106. doi: 10.1063/1.2339021.
10
Theoretical thermodynamics for large molecules: walking the thin line between accuracy and computational cost.大分子的理论热力学:在准确性和计算成本之间走钢丝。
Acc Chem Res. 2008 Apr;41(4):569-79. doi: 10.1021/ar700208h. Epub 2008 Mar 7.

引用本文的文献

1
Automatic molecular fragmentation by evolutionary optimisation.通过进化优化实现自动分子碎片化
J Cheminform. 2024 Aug 19;16(1):102. doi: 10.1186/s13321-024-00896-z.
2
Toward a general neural network force field for protein simulations: Refining the intramolecular interaction in protein.朝着蛋白质模拟的通用神经网络力场迈进:蛋白质中分子内相互作用的改进。
J Chem Phys. 2023 Jul 14;159(2). doi: 10.1063/5.0142280.
3
Association Complexes of Calix[6]arenes with Amino Acids Explained by Energy-Partitioning Methods.杯[6]芳烃与氨基酸配合物的能量分割方法解释。
Molecules. 2022 Nov 16;27(22):7938. doi: 10.3390/molecules27227938.
4
Linear-Scaling Systematic Molecular Fragmentation Approach for Perturbation Theory and Coupled-Cluster Methods.线性标度系统分子碎片方法用于微扰理论和耦合簇方法。
J Chem Theory Comput. 2022 Sep 13;18(9):5349-5359. doi: 10.1021/acs.jctc.2c00587. Epub 2022 Aug 16.
5
Fragment-Based Ab Initio Molecular Dynamics Simulation for Combustion.基于片段的从头算分子动力学模拟燃烧。
Molecules. 2021 May 23;26(11):3120. doi: 10.3390/molecules26113120.
6
Effective Fragment Potentials for Flexible Molecules: Transferability of Parameters and Amino Acid Database.柔性分子的有效片段势:参数的可转移性与氨基酸数据库
J Chem Theory Comput. 2020 Dec 8;16(12):7735-7747. doi: 10.1021/acs.jctc.0c00758. Epub 2020 Nov 25.
7
Study of the Wilcox torsion balance in solution for a Tröger's base derivative with hexyl-and heptyl substituents using a combined molecular mechanics and quantum chemistry approach.采用分子力学和量子化学相结合的方法,对具有己基和庚基取代基的特罗格碱衍生物在溶液中的威尔科克斯扭力天平进行研究。
J Mol Model. 2019 Feb 18;25(3):69. doi: 10.1007/s00894-019-3935-5.
8
Toward Building Protein Force Fields by Residue-Based Systematic Molecular Fragmentation and Neural Network.基于残基的系统分子片段化和神经网络构建蛋白质力场。
J Chem Theory Comput. 2019 Feb 12;15(2):1409-1417. doi: 10.1021/acs.jctc.8b00895. Epub 2019 Jan 7.
9
MoD-QM/MM Structural Refinement Method: Characterization of Hydrogen Bonding in the Oxytricha nova G-Quadruplex.国防部量子力学/分子力学结构优化方法:嗜热四膜虫G-四链体中氢键的表征
J Chem Theory Comput. 2014 Nov 11;10(11):5125-35. doi: 10.1021/ct500571k. Epub 2014 Oct 8.
10
Intermediate electrostatic field for the elongation method.用于拉伸法的中间静电场。
J Mol Model. 2014 Jun;20(6):2277. doi: 10.1007/s00894-014-2277-6. Epub 2014 May 31.