通过脉冲电子顺磁共振测量确定的HIV-1蛋白酶中的瓣间距离。 - Suppr

Suppr

超能文献

Interflap distances in HIV-1 protease determined by pulsed EPR measurements.

作者信息

Galiano Luis, Bonora Marco, Fanucci Gail E

机构信息

Department of Chemistry, University of Florida, P.O. Box 117200, Gainesville, Florida 32611, USA.

出版信息

J Am Chem Soc. 2007 Sep 12;129(36):11004-5. doi: 10.1021/ja073684k. Epub 2007 Aug 17.

DOI:10.1021/ja073684k

PMID:17705389

Abstract

摘要

相似文献

Interflap distances in HIV-1 protease determined by pulsed EPR measurements.通过脉冲电子顺磁共振测量确定的HIV-1蛋白酶中的瓣间距离。

J Am Chem Soc. 2007 Sep 12;129(36):11004-5. doi: 10.1021/ja073684k. Epub 2007 Aug 17.

Monitoring inhibitor-induced conformational population shifts in HIV-1 protease by pulsed EPR spectroscopy.通过脉冲电子顺磁共振波谱监测HIV-1蛋白酶中抑制剂诱导的构象群体转移。

Biochemistry. 2009 Sep 22;48(37):8765-7. doi: 10.1021/bi901201q.

Dynamics of "flap" structures in three HIV-1 protease/inhibitor complexes probed by total chemical synthesis and pulse-EPR spectroscopy.通过全化学合成和脉冲电子顺磁共振光谱研究三种HIV-1蛋白酶/抑制剂复合物中“瓣”结构的动力学

J Am Chem Soc. 2009 Jan 28;131(3):884-5. doi: 10.1021/ja806526z.

Solute effects on spin labels at an aqueous-exposed site in the flap region of HIV-1 protease.溶质对HIV-1蛋白酶活性区水暴露位点自旋标记的影响。

J Phys Chem B. 2009 Feb 12;113(6):1673-80. doi: 10.1021/jp8057788.

Catalytic contributions from remote regions of enzyme structure.酶结构远端区域的催化作用。

Chem Rev. 2011 Dec 14;111(12):7595-624. doi: 10.1021/cr100042n. Epub 2011 Sep 19.

Fluctuating partially native-like topologies in the acid denatured ensemble of autolysis resistant HIV-1 protease.抗自溶HIV-1蛋白酶酸变性聚集体中波动的部分类天然拓扑结构

Arch Biochem Biophys. 2009 Feb;482(1-2):33-41. doi: 10.1016/j.abb.2008.11.022. Epub 2008 Dec 6.

HIV-1 protease folding and the design of drugs which do not create resistance.HIV-1蛋白酶折叠与不会产生耐药性的药物设计。

Curr Opin Struct Biol. 2008 Feb;18(1):60-6. doi: 10.1016/j.sbi.2007.10.004. Epub 2007 Dec 21.

Coarse-grained molecular dynamics of ligands binding into protein: The case of HIV-1 protease inhibitors.配体与蛋白质结合的粗粒度分子动力学：以HIV-1蛋白酶抑制剂为例。

J Chem Phys. 2009 Jun 7;130(21):215102. doi: 10.1063/1.3148022.

X-ray structure of HIV-1 protease in situ product complex.HIV-1蛋白酶原位产物复合物的X射线结构

Proteins. 2009 Feb 15;74(3):594-602. doi: 10.1002/prot.22174.

Design of HIV protease inhibitors based on inorganic polyhedral metallacarboranes.基于无机多面体金属碳硼烷的HIV蛋白酶抑制剂设计

J Med Chem. 2009 Nov 26;52(22):7132-41. doi: 10.1021/jm9011388.

引用本文的文献

Natural Polymorphisms D60E and I62V Stabilize a Closed Conformation in HIV-1 Protease in the Absence of an Inhibitor or Substrate.天然多态性 D60E 和 I62V 使 HIV-1 蛋白酶在没有抑制剂或底物的情况下稳定在封闭构象。

Viruses. 2024 Feb 2;16(2):236. doi: 10.3390/v16020236.

Darunavir-Resistant HIV-1 Protease Constructs Uphold a Conformational Selection Hypothesis for Drug Resistance.达芦那韦耐药 HIV-1 蛋白酶构建体支持耐药性的构象选择假说。

Viruses. 2020 Nov 8;12(11):1275. doi: 10.3390/v12111275.

NMR and MD studies combined to elucidate inhibitor and water interactions of HIV-1 protease and their modulations with resistance mutations.NMR 和 MD 研究联合阐明了 HIV-1 蛋白酶抑制剂和水的相互作用及其与耐药突变的调节。

J Biomol NMR. 2019 Jul;73(6-7):365-374. doi: 10.1007/s10858-019-00260-6. Epub 2019 Jun 26.

Sequence, Structural Analysis and Metrics to Define the Unique Dynamic Features of the Flap Regions Among Aspartic Proteases.用于定义天冬氨酸蛋白酶中瓣区独特动态特征的序列、结构分析和指标

Protein J. 2017 Oct;36(5):385-396. doi: 10.1007/s10930-017-9735-9.

EPR Spectroscopy Targets Structural Changes in the E. coli Membrane Fusion CusB upon Cu(I) Binding.电子顺磁共振波谱法研究铜（I）结合后大肠杆菌膜融合蛋白CusB的结构变化

Biophys J. 2017 Jun 20;112(12):2494-2502. doi: 10.1016/j.bpj.2017.05.013.

The structural flexibility of the human copper chaperone Atox1: Insights from combined pulsed EPR studies and computations.人类铜伴侣蛋白Atox1的结构灵活性：来自脉冲电子顺磁共振联合研究与计算的见解

Protein Sci. 2017 Aug;26(8):1609-1618. doi: 10.1002/pro.3197. Epub 2017 May 31.

Effects of Hinge-region Natural Polymorphisms on Human Immunodeficiency Virus-Type 1 Protease Structure, Dynamics, and Drug Pressure Evolution.铰链区自然多态性对1型人类免疫缺陷病毒蛋白酶结构、动力学及药物压力演变的影响

J Biol Chem. 2016 Oct 21;291(43):22741-22756. doi: 10.1074/jbc.M116.747568. Epub 2016 Aug 30.

Pulsed EPR characterization of HIV-1 protease conformational sampling and inhibitor-induced population shifts.HIV-1蛋白酶构象采样及抑制剂诱导的种群转移的脉冲电子顺磁共振表征

Phys Chem Chem Phys. 2016 Feb 17;18(8):5819-31. doi: 10.1039/c5cp04556h.

Spin labeling and Double Electron-Electron Resonance (DEER) to Deconstruct Conformational Ensembles of HIV Protease.自旋标记与双电子-电子共振（DEER）用于解析HIV蛋白酶的构象集合

Methods Enzymol. 2015;564:153-87. doi: 10.1016/bs.mie.2015.07.019. Epub 2015 Sep 1.

Drug Resistance Mutations Alter Dynamics of Inhibitor-Bound HIV-1 Protease.耐药性突变改变与抑制剂结合的HIV-1蛋白酶的动力学。

J Chem Theory Comput. 2014 Aug 12;10(8):3438-3448. doi: 10.1021/ct4010454. Epub 2014 Jun 12.

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验