• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

[用于探索基因表达模式的主成分分析]

[Principal component analysis for exploring gene expression patterns].

作者信息

Wang Chengxiong, Rao Nini, Wang Yu

机构信息

College of Life Science and Technology, EST of China, Chengdu 610054, China.

出版信息

Sheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi. 2007 Aug;24(4):736-41.

PMID:17899734
Abstract

When projecting microarray data of yeast time series into principal component space based on time-points (arrays), we can not only ascribe biologically meaningful explanations to the first few principal components, but also discover sensible gene expression patterns and the according genes with periodic fluctuation this helps the subsequent research of gene periodic expression and gene regulatory network.

摘要

当基于时间点(阵列)将酵母时间序列的微阵列数据投影到主成分空间时,我们不仅可以对前几个主成分赋予生物学上有意义的解释,还能发现合理的基因表达模式以及具有周期性波动的相应基因,这有助于后续对基因周期性表达和基因调控网络的研究。

相似文献

1
[Principal component analysis for exploring gene expression patterns].[用于探索基因表达模式的主成分分析]
Sheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi. 2007 Aug;24(4):736-41.
2
Detecting stable clusters using principal component analysis.使用主成分分析检测稳定聚类。
Methods Mol Biol. 2003;224:159-82. doi: 10.1385/1-59259-364-X:159.
3
Fast network component analysis (FastNCA) for gene regulatory network reconstruction from microarray data.用于从微阵列数据重建基因调控网络的快速网络成分分析(FastNCA)
Bioinformatics. 2008 Jun 1;24(11):1349-58. doi: 10.1093/bioinformatics/btn131. Epub 2008 Apr 9.
4
Use of principal component analysis and the GE-biplot for the graphical exploration of gene expression data.主成分分析和GE双标图在基因表达数据图形化探索中的应用。
Biometrics. 2005 Jun;61(2):630-2; discussion 632-4. doi: 10.1111/j.1541-0420.2005.00366.x.
5
Analyzing time-dependent microarray data using independent component analysis derived expression modes from human macrophages infected with F. tularensis holartica.使用独立成分分析从感染全北区土拉弗朗西斯菌的人类巨噬细胞中分析随时间变化的微阵列数据及其衍生的表达模式。
J Biomed Inform. 2009 Aug;42(4):605-11. doi: 10.1016/j.jbi.2009.01.002. Epub 2009 Jan 23.
6
Block principal component analysis with application to gene microarray data classification.用于基因微阵列数据分类的块主成分分析
Stat Med. 2002 Nov 30;21(22):3465-74. doi: 10.1002/sim.1263.
7
Identifying genes from up-down properties of microarray expression series.从微阵列表达序列的升降特性中识别基因。
Bioinformatics. 2005 Oct 15;21(20):3859-64. doi: 10.1093/bioinformatics/bti549.
8
Clustering of change patterns using Fourier coefficients.使用傅里叶系数对变化模式进行聚类。
Bioinformatics. 2008 Jan 15;24(2):184-91. doi: 10.1093/bioinformatics/btm568. Epub 2007 Nov 19.
9
Dynamic architecture of the yeast cell cycle uncovered by wavelet decomposition of expression microarray data.通过表达微阵列数据的小波分解揭示酵母细胞周期的动态结构
Funct Integr Genomics. 2000 Nov;1(3):186-92. doi: 10.1007/s101420000027.
10
Stochastic dynamic modeling of short gene expression time-series data.短基因表达时间序列数据的随机动态建模
IEEE Trans Nanobioscience. 2008 Mar;7(1):44-55. doi: 10.1109/TNB.2008.2000149.

引用本文的文献

1
Specific Transcriptome Changes Associated with Blood Pressure Reduction in Hypertensive Patients After Relaxation Response Training.放松反应训练后高血压患者血压降低相关的特定转录组变化
J Altern Complement Med. 2018 May;24(5):486-504. doi: 10.1089/acm.2017.0053. Epub 2018 Apr 4.
2
Induced Human Decidual NK-Like Cells Improve Utero-Placental Perfusion in Mice.诱导人蜕膜自然杀伤样细胞可改善小鼠的子宫胎盘灌注。
PLoS One. 2016 Oct 13;11(10):e0164353. doi: 10.1371/journal.pone.0164353. eCollection 2016.
3
Identification of key regulators of pancreatic cancer progression through multidimensional systems-level analysis.
通过多维系统水平分析鉴定胰腺癌进展的关键调节因子。
Genome Med. 2016 May 3;8(1):38. doi: 10.1186/s13073-016-0282-3.
4
Transcriptional patterns in peritoneal tissue of encapsulating peritoneal sclerosis, a complication of chronic peritoneal dialysis.慢性腹膜透析并发症包裹性腹膜硬化症腹膜组织中的转录模式。
PLoS One. 2013;8(2):e56389. doi: 10.1371/journal.pone.0056389. Epub 2013 Feb 13.
5
Temporal network based analysis of cell specific vein graft transcriptome defines key pathways and hub genes in implantation injury.基于时变网络的细胞特异性静脉移植物转录组分析定义了植入损伤中的关键途径和枢纽基因。
PLoS One. 2012;7(6):e39123. doi: 10.1371/journal.pone.0039123. Epub 2012 Jun 15.