Suppr超能文献

网络BLAST:蛋白质网络的比较分析

NetworkBLAST: comparative analysis of protein networks.

作者信息

Kalaev Maxim, Smoot Mike, Ideker Trey, Sharan Roded

机构信息

School of Computer Science, Tel Aviv University, Tel Aviv 69978, Israel.

出版信息

Bioinformatics. 2008 Feb 15;24(4):594-6. doi: 10.1093/bioinformatics/btm630. Epub 2008 Jan 2.

Abstract

UNLABELLED

The identification of protein complexes is a fundamental challenge in interpreting protein-protein interaction data. Cross-species analysis allows coping with the high levels of noise that are typical to these data. The NetworkBLAST web-server provides a platform for identifying protein complexes in protein-protein interaction networks. It can analyze a single network or two networks from different species. In the latter case, NetworkBLAST outputs a set of putative complexes that are evolutionarily conserved across the two networks.

AVAILABILITY

NetworkBLAST is available as web-server at: www.cs.tau.ac.il/~roded/networkblast.htm.

摘要

未标注

蛋白质复合物的识别是解读蛋白质-蛋白质相互作用数据时面临的一项基本挑战。跨物种分析有助于应对这些数据中常见的高水平噪声。NetworkBLAST网络服务器提供了一个在蛋白质-蛋白质相互作用网络中识别蛋白质复合物的平台。它可以分析单个网络或来自不同物种的两个网络。在后一种情况下,NetworkBLAST会输出一组在两个网络中进化上保守的假定复合物。

可用性

NetworkBLAST可作为网络服务器在以下网址获取:www.cs.tau.ac.il/~roded/networkblast.htm。

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