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Mireval:一种用于在基因组序列中进行简单微小RNA预测的网络工具。

Mireval: a web tool for simple microRNA prediction in genome sequences.

作者信息

Ritchie William, Théodule François-Xavier, Gautheret Daniel

机构信息

INSERM U928, Technologies Avancées pour le Génome et la Clinique, Luminy Case 906, 13288 Marseille, Cedex 09, France.

出版信息

Bioinformatics. 2008 Jun 1;24(11):1394-6. doi: 10.1093/bioinformatics/btn137. Epub 2008 May 3.

DOI:10.1093/bioinformatics/btn137
PMID:18453555
Abstract

SUMMARY

We have developed an online tool called mirEval which can search sequences of up to 10 000 nt for novel microRNAs in multiple organisms. It is a comprehensive tool, easy to use and very informative. It will allow users with no prior knowledge of in-silico detection of microRNAs to take advantage of the most successful approaches to investigate sequences of interest.

AVAILABILITY

The mirEval web server is available at http://tagc.univ-mrs.fr/mireval

摘要

摘要

我们开发了一种名为mirEval的在线工具,它可以在多种生物中搜索长度达10000个核苷酸的序列以寻找新型微小RNA。它是一个综合性工具,易于使用且信息丰富。它将使那些此前没有微小RNA计算机检测知识的用户能够利用最成功的方法来研究感兴趣的序列。

可用性

mirEval网络服务器可在http://tagc.univ-mrs.fr/mireval获取。

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