• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

用于染色质靶向RNA干扰的输入和输出。

Inputs and outputs for chromatin-targeted RNAi.

作者信息

Chan Simon W-L

机构信息

Department of Plant Biology, University of California, Davis, 1 Shields Avenue, Davis, CA 95616, USA.

出版信息

Trends Plant Sci. 2008 Jul;13(7):383-9. doi: 10.1016/j.tplants.2008.05.001. Epub 2008 Jun 10.

DOI:10.1016/j.tplants.2008.05.001
PMID:18550415
Abstract

Plant gene silencing is targeted to transposons and repeated sequences by small RNAs from the RNA interference (RNAi) pathway. Like classical RNAi, RNA-directed chromatin silencing involves the cleavage of double-stranded RNA by Dicer endonucleases to create small interfering RNAs (siRNAs), which bind to the Argonaute protein. The production of double-stranded RNA (dsRNA) must be carefully controlled to prevent inappropriate silencing. A plant-specific RNA polymerase IV (Pol IV) initiates siRNA production at silent heterochromatin, but Pol IV-independent mechanisms for making dsRNA also exist. Downstream of siRNA biogenesis, multiple chromatin marks might be targeted by Argonaute-siRNA complexes, yet mechanisms of chromatin modification remain poorly understood. Genomic studies of siRNA target loci promise to reveal novel biological functions for chromatin-targeted RNAi.

摘要

植物基因沉默通过RNA干扰(RNAi)途径产生的小RNA靶向转座子和重复序列。与经典RNAi一样,RNA指导的染色质沉默涉及Dicer核酸内切酶切割双链RNA以产生小干扰RNA(siRNA),这些小干扰RNA与Argonaute蛋白结合。双链RNA(dsRNA)的产生必须受到严格控制,以防止不适当的沉默。一种植物特异性RNA聚合酶IV(Pol IV)在沉默的异染色质处启动siRNA的产生,但也存在不依赖Pol IV产生dsRNA的机制。在siRNA生物合成的下游,Argonaute-siRNA复合物可能靶向多种染色质标记,但染色质修饰的机制仍知之甚少。对siRNA靶位点的基因组研究有望揭示染色质靶向RNAi的新生物学功能。

相似文献

1
Inputs and outputs for chromatin-targeted RNAi.用于染色质靶向RNA干扰的输入和输出。
Trends Plant Sci. 2008 Jul;13(7):383-9. doi: 10.1016/j.tplants.2008.05.001. Epub 2008 Jun 10.
2
RNA-interference-directed chromatin modification coupled to RNA polymerase II transcription.与RNA聚合酶II转录偶联的RNA干扰介导的染色质修饰。
Nature. 2005 Jun 30;435(7046):1275-9. doi: 10.1038/nature03652. Epub 2005 Jun 19.
3
[Great potential of small RNAs: RNA interference and microRNA].[小RNA的巨大潜力:RNA干扰与微小RNA]
Rev Invest Clin. 2006 Jul-Aug;58(4):335-49.
4
Studies on the mechanism of RNAi-dependent heterochromatin assembly.RNA干扰依赖性异染色质组装机制的研究。
Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2006;71:461-71. doi: 10.1101/sqb.2006.71.044.
5
RNA interference--significance and applications.RNA干扰——意义与应用
Arch Immunol Ther Exp (Warsz). 2005 Jan-Feb;53(1):39-46.
6
The Argonautes.阿尔戈英雄
Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2006;71:67-72. doi: 10.1101/sqb.2006.71.048.
7
Small but mighty RNA-mediated interference in plants.植物中微小却强大的RNA介导的干扰
Indian J Exp Biol. 2005 Jan;43(1):7-24.
8
DICER-LIKE 4 is required for RNA interference and produces the 21-nucleotide small interfering RNA component of the plant cell-to-cell silencing signal.RNA干扰需要DICER-LIKE 4,它能产生植物细胞间沉默信号中的21个核苷酸的小干扰RNA成分。
Nat Genet. 2005 Dec;37(12):1356-60. doi: 10.1038/ng1675. Epub 2005 Nov 6.
9
Coupling of double-stranded RNA synthesis and siRNA generation in fission yeast RNAi.裂殖酵母RNA干扰中双链RNA合成与小干扰RNA生成的偶联
Mol Cell. 2007 Aug 3;27(3):449-61. doi: 10.1016/j.molcel.2007.07.007. Epub 2007 Jul 19.
10
Endogenous siRNAs from naturally formed dsRNAs regulate transcripts in mouse oocytes.源自天然形成双链RNA的内源性小干扰RNA调控小鼠卵母细胞中的转录本。
Nature. 2008 May 22;453(7194):539-43. doi: 10.1038/nature06908. Epub 2008 Apr 10.

引用本文的文献

1
Enhancing lipid production in via RNAi-mediated downregulation of carbohydrate biosynthesis.通过RNA干扰介导的碳水化合物生物合成下调来提高脂质产量。 (注:原文“Enhancing lipid production in via...”表述似乎不完整,缺少具体的主体,这里按完整意思翻译)
Front Microbiol. 2025 May 21;16:1601691. doi: 10.3389/fmicb.2025.1601691. eCollection 2025.
2
EAT1 transcription factor, a non-cell-autonomous regulator of pollen production, activates meiotic small RNA biogenesis in rice anther tapetum.EAT1 转录因子,花粉产生的非细胞自主调控因子,在水稻花药绒毡层中激活减数分裂小 RNA 的生物发生。
PLoS Genet. 2018 Feb 12;14(2):e1007238. doi: 10.1371/journal.pgen.1007238. eCollection 2018 Feb.
3
Chromosomes carrying meiotic avoidance loci in three apomictic eudicot Hieracium subgenus Pilosella species share structural features with two monocot apomicts.
携带减数分裂回避基因座的染色体在三种无融合生殖的菊科帚菊属 Pilosella 物种中与两种单子叶无融合生殖植物具有相同的结构特征。
Plant Physiol. 2011 Nov;157(3):1327-41. doi: 10.1104/pp.111.181164. Epub 2011 Sep 6.
4
Functional specialization of Piwi proteins in Paramecium tetraurelia from post-transcriptional gene silencing to genome remodelling.棘皮动物 Piwi 蛋白在四膜虫中的功能特化 从转录后基因沉默到基因组重塑。
Nucleic Acids Res. 2011 May;39(10):4249-64. doi: 10.1093/nar/gkq1283. Epub 2011 Jan 7.
5
Epigenetic control of plant immunity.植物免疫的表观遗传控制。
Mol Plant Pathol. 2010 Jul;11(4):563-76. doi: 10.1111/j.1364-3703.2010.00621.x.
6
Epigenetic effects of endocrine-disrupting chemicals on female reproduction: an ovarian perspective.内分泌干扰物对女性生殖的表观遗传效应:卵巢视角。
Front Neuroendocrinol. 2010 Oct;31(4):420-39. doi: 10.1016/j.yfrne.2010.06.003. Epub 2010 Jul 4.
7
MicroRNA and tasiRNA diversity in mature pollen of Arabidopsis thaliana.拟南芥成熟花粉中的 microRNA 和 tasiRNA 多样性。
BMC Genomics. 2009 Dec 30;10:643. doi: 10.1186/1471-2164-10-643.
8
Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences.碱基分辨率下的人类DNA甲基化组显示出广泛的表观基因组差异。
Nature. 2009 Nov 19;462(7271):315-22. doi: 10.1038/nature08514. Epub 2009 Oct 14.
9
Gene silencing in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.海洋硅藻三角褐指藻中的基因沉默
Nucleic Acids Res. 2009 Aug;37(14):e96. doi: 10.1093/nar/gkp448. Epub 2009 May 31.
10
Small silencing RNAs: an expanding universe.小干扰RNA:一个不断扩展的领域。
Nat Rev Genet. 2009 Feb;10(2):94-108. doi: 10.1038/nrg2504.