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异化型 DsrAB 亚硫酸盐还原酶与 DsrC 复合物的纯化、结晶及初步晶体学分析

Purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of a dissimilatory DsrAB sulfite reductase in complex with DsrC.

机构信息

Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Universidade Nova de Lisboa (ITQB-UNL), Av. da República-EAN, 2780-157 Oeiras, Portugal.

出版信息

J Struct Biol. 2008 Nov;164(2):236-9. doi: 10.1016/j.jsb.2008.07.007. Epub 2008 Jul 31.

Abstract

Dissimilatory sulfite reductase (dSiR, DsrAB) is a key protein in dissimilatory sulfur metabolism, one of the earliest types of energy metabolism to be traced on earth. dSirs are large oligomeric proteins around 200kDa forming an alpha(2)beta(2) arrangement and including a unique siroheme-[4Fe-4S] coupled cofactor. Here, we report the purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of dSir isolated from Desulfovibrio vulgaris Hildenborough, also known as desulfoviridin. In this enzyme the DsrAB protein is associated with DsrC, a protein of unknown function that is believed to play an important role in the sulfite reduction. Crystals belong to the monoclinic space group P2(1) with unit-cell parameters a=122.7, b=119.4 and c=146.7A and beta =110.0 degrees , and diffract X-rays to 2.8A on a synchrotron source.

摘要

异化亚硫酸盐还原酶(dSiR,DsrAB)是异化硫代谢中的关键蛋白,是地球上最早追踪到的能量代谢类型之一。dSirs 是大约 200kDa 的大型寡聚蛋白,形成 alpha(2)beta(2)排列,并包含独特的 siroheme-[4Fe-4S]偶联辅因子。在这里,我们报告了从脱硫弧菌 Hildenborough(也称为脱硫菌)中分离出的 dSir 的纯化、结晶和初步 X 射线衍射分析。在这种酶中,DsrAB 蛋白与 DsrC 相关,DsrC 是一种未知功能的蛋白质,据信在亚硫酸盐还原中发挥重要作用。晶体属于单斜晶系 P2(1),具有单元细胞参数 a=122.7、b=119.4 和 c=146.7A 和 beta =110.0 度,在同步辐射源上可衍射至 2.8A。

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