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Bioinformatics resources for the study of gene regulation in bacteria.用于研究细菌基因调控的生物信息学资源。
J Bacteriol. 2009 Jan;191(1):23-31. doi: 10.1128/JB.01017-08. Epub 2008 Oct 31.
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Gene. 1981 Dec;16(1-3):347-52. doi: 10.1016/0378-1119(81)90093-7.
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Mol Microbiol. 2007 Apr;64(1):42-56. doi: 10.1111/j.1365-2958.2007.05596.x.
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Bacterial regulatory networks are extremely flexible in evolution.细菌调控网络在进化过程中极具灵活性。
Nucleic Acids Res. 2006 Jul 13;34(12):3434-45. doi: 10.1093/nar/gkl423. Print 2006.
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Identifying conserved gene clusters in the presence of homology families.在存在同源家族的情况下识别保守基因簇。
J Comput Biol. 2005 Jul-Aug;12(6):638-56. doi: 10.1089/cmb.2005.12.638.
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Can laboratory reference strains mirror "real-world" pathogenesis?实验室参考菌株能否反映“现实世界”中的发病机制？
Trends Microbiol. 2005 Feb;13(2):58-63. doi: 10.1016/j.tim.2004.11.001.
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A multi-approaches-guided genetic algorithm with application to operon prediction.一种多方法引导的遗传算法及其在操纵子预测中的应用。
Artif Intell Med. 2007 Oct;41(2):151-9. doi: 10.1016/j.artmed.2007.07.010. Epub 2007 Sep 14.
8
[Cloning and regulation of the expression of the lysA gene from Bacillus subtilis].[枯草芽孢杆菌lysA基因的克隆及表达调控]
Genetika. 1992 May;28(5):5-10.
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The regulation of transcription initiation in bacteria.细菌中转录起始的调控。
Annu Rev Genet. 1985;19:355-87. doi: 10.1146/annurev.ge.19.120185.002035.
10
Conservation of gene co-regulation between two prokaryotes: Bacillus subtilis and Escherichia coli.两种原核生物——枯草芽孢杆菌和大肠杆菌之间基因共调控的保守性。
Genome Inform. 2005;16(1):116-24.

引用本文的文献

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Profiling Salmonella transcriptional dynamics during macrophage infection using a comprehensive reporter library.利用全面的报告基因文库分析巨噬细胞感染期间沙门氏菌的转录动力学。
Nat Microbiol. 2025 Apr;10(4):1006-1023. doi: 10.1038/s41564-025-01953-5. Epub 2025 Apr 2.
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Redefining fundamental concepts of transcription initiation in bacteria.重新定义细菌中转录起始的基本概念。
Nat Rev Genet. 2020 Nov;21(11):699-714. doi: 10.1038/s41576-020-0254-8. Epub 2020 Jul 14.
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J Bacteriol. 2020 Apr 27;202(10). doi: 10.1128/JB.00072-20.
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Antibiotic Resistance and Epigenetics: More to It than Meets the Eye.抗生素耐药性与表观遗传学：比我们想象的更复杂。
Antimicrob Agents Chemother. 2020 Jan 27;64(2). doi: 10.1128/AAC.02225-19.
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Bioinformatics resources for the study of gene regulation in bacteria.

作者信息

Collado-Vides Julio, Salgado Heladia, Morett Enrique, Gama-Castro Socorro, Jiménez-Jacinto Verónica, Martínez-Flores Irma, Medina-Rivera Alejandra, Muñiz-Rascado Luis, Peralta-Gil Martín, Santos-Zavaleta Alberto

机构信息

Programa de Genómica Computacional, Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, A.P. 565-A, Cuernavaca, Morelos 62100, Mexico.

出版信息

J Bacteriol. 2009 Jan;191(1):23-31. doi: 10.1128/JB.01017-08. Epub 2008 Oct 31.

DOI:10.1128/JB.01017-08
PMID:18978060
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2612416/
Abstract
摘要