• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

核酸位点特异性共价标记的新策略。

Novel strategies for the site-specific covalent labelling of nucleic acids.

作者信息

Weisbrod Samuel H, Marx Andreas

机构信息

Department of Chemistry and Konstanz Research School Chemical Biology, University of Konstanz, 78457, Konstanz, Germany.

出版信息

Chem Commun (Camb). 2008 Nov 30(44):5675-85. doi: 10.1039/b809528k. Epub 2008 Sep 25.

DOI:10.1039/b809528k
PMID:19009049
Abstract

To broaden the scope of applications in DNA nano- and biotechnology, material science, diagnostics and molecular recognition the functionalization of DNA is of utmost importance. In the last decade many new methods have been developed to achieve this goal. Apart from the direct chemical synthesis of modified DNA by automated phosphoramidite chemistry incorporation of labelled triphosphates and the post-synthetic labelling approach evolved as valuable methods. New bioorthogonal reactions as Diels-Alder, click and Staudinger ligations pushed forward the post-synthetic approach as new insights into DNA polymerase substrate specificity allowed generation and amplification of labelled DNA strands. These novel developments are summarized herein.

摘要

为了拓宽DNA在纳米生物技术、材料科学、诊断学和分子识别等领域的应用范围,DNA的功能化至关重要。在过去十年中,已经开发出许多新方法来实现这一目标。除了通过自动亚磷酰胺化学直接化学合成修饰的DNA、掺入标记的三磷酸以及合成后标记方法外,还发展出了有价值的方法。新型生物正交反应如狄尔斯-阿尔德反应、点击反应和施陶丁格连接反应推动了合成后方法的发展,因为对DNA聚合酶底物特异性的新认识使得标记DNA链的生成和扩增成为可能。本文总结了这些新进展。

相似文献

1
Novel strategies for the site-specific covalent labelling of nucleic acids.核酸位点特异性共价标记的新策略。
Chem Commun (Camb). 2008 Nov 30(44):5675-85. doi: 10.1039/b809528k. Epub 2008 Sep 25.
2
Post-synthetic modification of DNA by inverse-electron-demand Diels-Alder reaction.通过逆电子需求 Diels-Alder 反应对 DNA 进行后合成修饰。
J Am Chem Soc. 2010 Jul 7;132(26):8846-7. doi: 10.1021/ja102871p.
3
Cross-coupling reactions of nucleoside triphosphates followed by polymerase incorporation. Construction and applications of base-functionalized nucleic acids.核苷三磷酸的交叉偶联反应,随后进行聚合酶掺入。碱基功能化核酸的构建与应用。
Org Biomol Chem. 2008 Jul 7;6(13):2233-41. doi: 10.1039/b803664k. Epub 2008 Apr 2.
4
A versatile toolbox for variable DNA functionalization at high density.用于高密度可变DNA功能化的多功能工具箱。
J Am Chem Soc. 2005 Nov 2;127(43):15071-82. doi: 10.1021/ja051725b.
5
Site-specific DNA labeling by Staudinger ligation.通过施陶丁格连接进行位点特异性DNA标记。
Methods Mol Biol. 2011;751:195-207. doi: 10.1007/978-1-61779-151-2_12.
6
The first chemical synthesis of boronic acid-modified DNA through a copper-free click reaction.通过无铜点击反应首次实现了硼烷修饰 DNA 的化学合成。
Chem Commun (Camb). 2011 Mar 28;47(12):3598-600. doi: 10.1039/c0cc04546b. Epub 2011 Feb 8.
7
Nucleobase modification as redox DNA labelling for electrochemical detection.碱基修饰作为电化学检测的氧化还原 DNA 标记。
Chem Soc Rev. 2011 Dec;40(12):5802-14. doi: 10.1039/c1cs15049a. Epub 2011 May 31.
8
Synthesis of highly modified DNA by a combination of PCR with alkyne-bearing triphosphates and click chemistry.通过聚合酶链式反应(PCR)与含炔基三磷酸酯及点击化学相结合来合成高度修饰的DNA。
Chemistry. 2007;13(34):9486-94. doi: 10.1002/chem.200700502.
9
Click chemistry and bioorthogonal reactions: unprecedented selectivity in the labeling of biological molecules.点击化学与生物正交反应:生物分子标记中前所未有的选择性。
Biochemistry. 2009 Jul 21;48(28):6571-84. doi: 10.1021/bi9007726.
10
Enzymatic synthesis of perfluoroalkylated DNA.全氟烷基化DNA的酶促合成。
Bioorg Med Chem. 2009 May 15;17(10):3653-8. doi: 10.1016/j.bmc.2009.03.063. Epub 2009 Apr 7.

引用本文的文献

1
Control of Solid-Supported Intra- vs Interstrand Stille Coupling Reactions for Synthesis of DNA-Oligophenylene Conjugates.控制固相支载的链内-链间 Stille 偶联反应以合成 DNA-寡联苯缀合物。
Bioconjug Chem. 2024 Aug 21;35(8):1166-1171. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.4c00310. Epub 2024 Jul 24.
2
Tellurium-Modified Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids with Potential Applications.碲化修饰的核苷、核苷酸和核酸及其潜在应用。
Molecules. 2022 Dec 1;27(23):8379. doi: 10.3390/molecules27238379.
3
Strategies for Covalent Labeling of Long RNAs.
长 RNA 的共价标记策略。
Chembiochem. 2021 Oct 1;22(19):2826-2847. doi: 10.1002/cbic.202100161. Epub 2021 Jun 17.
4
New Alkyne and Amine Linkers for Versatile Multiple Conjugation of Oligonucleotides.用于寡核苷酸多功能多重共轭的新型炔烃和胺连接子
ACS Omega. 2020 Dec 18;6(1):579-593. doi: 10.1021/acsomega.0c05075. eCollection 2021 Jan 12.
5
Nucleic Acid Conformation Influences Postsynthetic Suzuki-Miyaura Labeling of Oligonucleotides.核酸构象影响寡核苷酸的后期Suzuki-Miyaura 标记。
Bioconjug Chem. 2020 Nov 18;31(11):2513-2521. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.0c00466. Epub 2020 Oct 22.
6
Bioorthogonal chemistry-based RNA labeling technologies: evolution and current state.基于生物正交化学的 RNA 标记技术:发展与现状。
Chem Commun (Camb). 2020 Oct 21;56(82):12307-12318. doi: 10.1039/d0cc05228k. Epub 2020 Oct 7.
7
Posttranscriptional Suzuki-Miyaura Cross-Coupling Yields Labeled RNA for Conformational Analysis and Imaging.转录后 Suzuki-Miyaura 交叉偶联为构象分析和成像提供标记 RNA。
Methods Mol Biol. 2020;2166:473-486. doi: 10.1007/978-1-0716-0712-1_27.
8
Synthesis of Wavelength-Shifting Fluorescent DNA and RNA with Two Photostable Cyanine-Styryl Dyes as the Base Surrogate Pair.以两种光稳定的花菁-苯乙烯基染料作为碱基替代对合成波长转移荧光DNA和RNA。
ChemistryOpen. 2017 Jun 7;6(4):514-518. doi: 10.1002/open.201700059. eCollection 2017 Aug.
9
Comparative Study of Novel Fluorescent Cyanine Nucleotides: Hybridization Analysis of Labeled PCR Products Using a Biochip.新型荧光氰基核苷酸的比较研究:利用生物芯片对标记 PCR 产物进行杂交分析。
J Fluoresc. 2017 Nov;27(6):2001-2016. doi: 10.1007/s10895-017-2139-6. Epub 2017 Jul 28.
10
Synthesis and Excellent Duplex Stability of Oligonucleotides Containing 2'-Amino-LNA Functionalized with Galactose Units.含有半乳糖单元功能化的2'-氨基锁核酸的寡核苷酸的合成及其优异的双链稳定性
Molecules. 2017 May 21;22(5):852. doi: 10.3390/molecules22050852.