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DIYA:适用于任何基因组学实验室的细菌注释流程。

DIYA: a bacterial annotation pipeline for any genomics lab.

作者信息

Stewart Andrew C, Osborne Brian, Read Timothy D

机构信息

Genomics Department, Biological Defense Research Directorate, Naval Medical Research Center, Rockville, MD, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2009 Apr 1;25(7):962-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btp097. Epub 2009 Mar 2.

DOI:10.1093/bioinformatics/btp097
PMID:19254921
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2660880/
Abstract

UNLABELLED

DIYA (Do-It-Yourself Annotator) is a modular and configurable open source pipeline software, written in Perl, used for the rapid annotation of bacterial genome sequences. The software is currently used to take DNA contigs as input, either in the form of complete genomes or the result of shotgun sequencing, and produce an annotated sequence in Genbank file format as output.

AVAILABILITY

Distribution and source code are available at (https://sourceforge.net/projects/diyg/).

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Supplementary data are available at Bioinformatics online.

摘要

未标注

DIYA(自己动手注释器)是一个模块化且可配置的开源管道软件,用Perl编写,用于细菌基因组序列的快速注释。该软件目前用于将DNA重叠群作为输入,其形式可以是完整基因组或鸟枪法测序的结果,并生成Genbank文件格式的注释序列作为输出。

可用性

可在(https://sourceforge.net/projects/diyg/)获取发行版和源代码。

补充信息

补充数据可在《生物信息学》在线版获取。