Suppr超能文献

基序调整器:一种用于转录因子结合位点注释计算重新评估的工具。

MotifAdjuster: a tool for computational reassessment of transcription factor binding site annotations.

作者信息

Keilwagen Jens, Baumbach Jan, Kohl Thomas A, Grosse Ivo

机构信息

Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research Gatersleben (IPK), Corrensstrasse 3, 06466 Gatersleben, Germany.

出版信息

Genome Biol. 2009;10(5):R46. doi: 10.1186/gb-2009-10-5-r46. Epub 2009 May 1.

Abstract

Valuable binding-site annotation data are stored in databases. However, several types of errors can, and do, occur in the process of manually incorporating annotation data from the scientific literature into these databases. Here, we introduce MotifAdjuster http://dig.ipk-gatersleben.de/MotifAdjuster.html, a tool that helps to detect these errors, and we demonstrate its efficacy on public data sets.

摘要

有价值的结合位点注释数据存储在数据库中。然而,在将科学文献中的注释数据手动整合到这些数据库的过程中,可能而且确实会出现几种类型的错误。在这里,我们介绍MotifAdjuster(http://dig.ipk-gatersleben.de/MotifAdjuster.html),一种有助于检测这些错误的工具,并在公共数据集上展示了其有效性。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6388/2718512/23092ef55d12/gb-2009-10-5-r46-1.jpg

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