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用于分析DNA序列的窗口大小的确定

Determination of window size for analyzing DNA sequences.

作者信息

Tajima F

机构信息

National Institute of Genetics, Shizuoka, Japan.

出版信息

J Mol Evol. 1991 Nov;33(5):470-3. doi: 10.1007/BF02103140.

Abstract

DNA sequences are generally not random sequences. To show such nonrandomness visually, DNA sequence data are often plotted as moving averages for a certain length of window slid along a sequence. Here a simple algorithm is presented for determining the window size and for finding a nonrandom region of sequence.

摘要

DNA序列通常不是随机序列。为了直观地展示这种非随机性,DNA序列数据常常被绘制成沿着序列滑动的特定长度窗口的移动平均值。这里提出一种简单算法,用于确定窗口大小并找到序列的非随机区域。

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