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YADA：一款充分利用高分辨率光谱的工具。

YADA: a tool for taking the most out of high-resolution spectra.

机构信息

Systems Engineering and Computer Science Program, COPPE, Federal University of Rio de Janeiro, Caixa Postal 68511, 21941-972 Rio de Janeiro-RJ, Brazil.

出版信息

Bioinformatics. 2009 Oct 15;25(20):2734-6. doi: 10.1093/bioinformatics/btp489. Epub 2009 Aug 14.

DOI:10.1093/bioinformatics/btp489
PMID:19684088
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3140806/
Abstract

UNLABELLED

YADA can deisotope and decharge high-resolution mass spectra from large peptide molecules, link the precursor monoisotopic peak information to the corresponding tandem mass spectrum, and account for different co-fragmenting ion species (multiplexed spectra). We describe how YADA enables a pipeline consisting of ProLuCID and DTASelect for analyzing large-scale middle-down proteomics data.

AVAILABILITY

http://fields.scripps.edu/yada

摘要

未加标签

YADA 可以对大肽分子进行去同位素和去电荷，将前体单同位素峰信息与相应的串联质谱联系起来，并解释不同的共碎裂离子种类（多路谱）。我们描述了 YADA 如何支持由 ProLuCID 和 DTASelect 组成的管道，用于分析大规模的中间向下蛋白质组学数据。

网址

http://fields.scripps.edu/yada

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f9d5/3140806/ad154053fc6d/btp489f1.jpg
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