• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

扁盘动物线粒体中的I组内含子反式剪接和mRNA编辑

Group I-intron trans-splicing and mRNA editing in the mitochondria of placozoan animals.

作者信息

Burger Gertraud, Yan Yifei, Javadi Pasha, Lang B Franz

机构信息

Robert Cedergren Centre for Bioinformatics and Genomics, Département de Biochimie, Université de Montréal, C.P. 6128, Montréal, Québec, H3T 1J4, Canada.

出版信息

Trends Genet. 2009 Sep;25(9):381-6. doi: 10.1016/j.tig.2009.07.003. Epub 2009 Aug 27.

DOI:10.1016/j.tig.2009.07.003
PMID:19716620
Abstract

Placozoa - the simplest known free-living animals - have been considered primitive, early diverging metazoans based on mitochondrial genome structure and phylogeny. Here we reanalyze placozoan mitochondrial DNAs, reported to include a highly unorthodox, fragmented and incomplete cox1 gene. We discover overlooked exons and split group I introns that mediate trans-splicing of the discontinuous placozoan cox1. Furthermore, we find that cox1 expression involves U-to-C editing, reconstituting an otherwise invariant, essential histidine involved in copper binding. These atypical features qualify placozoan mitochondrial gene and genome organization as derived rather than primitive. Whether the Placozoa diverged early or late during metazoan evolution remains unresolved by mitochondrial phylogeny.

摘要

扁盘动物门——已知最简单的自由生活动物——基于线粒体基因组结构和系统发育,一直被认为是原始的、早期分化的后生动物。在此,我们重新分析了扁盘动物的线粒体DNA,据报道其包含一个高度非正统、片段化且不完整的细胞色素c氧化酶亚基1(cox1)基因。我们发现了被忽视的外显子和介导不连续扁盘动物cox1反式剪接的I组内含子。此外,我们发现cox1的表达涉及U到C的编辑,从而重建了一个原本不变的、参与铜结合的必需组氨酸。这些非典型特征表明扁盘动物线粒体基因和基因组组织是衍生的而非原始的。扁盘动物门在后生动物进化过程中是早期还是晚期分化,线粒体系统发育仍未解决。

相似文献

1
Group I-intron trans-splicing and mRNA editing in the mitochondria of placozoan animals.扁盘动物线粒体中的I组内含子反式剪接和mRNA编辑
Trends Genet. 2009 Sep;25(9):381-6. doi: 10.1016/j.tig.2009.07.003. Epub 2009 Aug 27.
2
Ancestors of trans-splicing mitochondrial introns support serial sister group relationships of hornworts and mosses with vascular plants.反式剪接线粒体内含子的祖先支持角苔和苔藓与维管植物的系列姐妹群关系。
Mol Biol Evol. 2005 Jan;22(1):117-25. doi: 10.1093/molbev/msh259. Epub 2004 Sep 8.
3
Deep RNA sequencing reveals the smallest known mitochondrial micro exon in animals: The placozoan cox1 single base pair exon.深度RNA测序揭示了动物中已知最小的线粒体微小外显子:扁盘动物的细胞色素c氧化酶亚基1单碱基对外显子。
PLoS One. 2017 May 18;12(5):e0177959. doi: 10.1371/journal.pone.0177959. eCollection 2017.
4
Evolutionarily conserved cox1 trans-splicing without cis-motifs.没有顺式元件的进化保守性 cox1 反式剪接。
Mol Biol Evol. 2011 Sep;28(9):2425-8. doi: 10.1093/molbev/msr075. Epub 2011 Mar 23.
5
Mitochondrial group II introns in the raphidophycean flagellate Chattonella spp. suggest a diatom-to-Chattonella lateral group II intron transfer.针胞藻鞭毛藻赤潮异弯藻属中的线粒体II类内含子表明硅藻到赤潮异弯藻属存在II类内含子侧向转移。
Protist. 2009 Aug;160(3):364-75. doi: 10.1016/j.protis.2009.02.003. Epub 2009 Apr 5.
6
Cis- and trans-splicing of group II introns in plant mitochondria.植物线粒体中II类内含子的顺式和反式剪接
Mitochondrion. 2008 Jan;8(1):26-34. doi: 10.1016/j.mito.2007.09.005. Epub 2007 Oct 11.
7
The highly reduced and fragmented mitochondrial genome of the early-branching dinoflagellate Oxyrrhis marina shares characteristics with both apicomplexan and dinoflagellate mitochondrial genomes.早期分支的双鞭毛虫海洋尖尾藻高度简化且碎片化的线粒体基因组兼具顶复门和双鞭毛虫线粒体基因组的特征。
J Mol Biol. 2007 Sep 14;372(2):356-68. doi: 10.1016/j.jmb.2007.06.085. Epub 2007 Jul 3.
8
Group I intron-mediated trans-splicing in mitochondria of Gigaspora rosea and a robust phylogenetic affiliation of arbuscular mycorrhizal fungi with Mortierellales.大团囊霉线粒体中的 I 类内含子介导的转剪接及与毛霉目的丛枝菌根真菌的密切系统发育关系。
Mol Biol Evol. 2012 Sep;29(9):2199-210. doi: 10.1093/molbev/mss088. Epub 2012 Mar 12.
9
DNA double-strand break in vivo at the 3' extremity of exons located upstream of group II introns. Senescence and circular DNA introns in Podospora mitochondria.II类内含子上游外显子3'末端的体内DNA双链断裂。柄孢壳菌线粒体中的衰老与环状DNA内含子。
J Mol Biol. 1994 Oct 7;242(5):630-43. doi: 10.1006/jmbi.1994.1613.
10
A PPR-DYW protein is required for splicing of a group II intron of cox1 pre-mRNA in Physcomitrella patens.在Physcomitrella patens 中,APPR-DYW 蛋白对于 cox1 前体 mRNA 中 II 组内含子的剪接是必需的。
Plant J. 2012 Apr;70(2):271-8. doi: 10.1111/j.1365-313X.2011.04869.x. Epub 2012 Jan 10.

引用本文的文献

1
Genomic Insights into Diversity: The Genome of Two Clinical Isolates and Their Demethylase Inhibitor Fungicides Susceptibility.多样性的基因组见解:两种临床分离株的基因组及其对去甲基化酶抑制剂类杀菌剂的敏感性
Pathogens. 2024 Dec 3;13(12):1062. doi: 10.3390/pathogens13121062.
2
Mitochondrial DNA of the Demosponge Acanthella acuta: Linear Architecture and Other Unique Features.尖叶软柳珊瑚线粒体 DNA:线性结构及其他独特特征。
Genome Biol Evol. 2024 Aug 5;16(8). doi: 10.1093/gbe/evae168.
3
Phylomitogenomics bolsters the high-level classification of Demospongiae (phylum Porifera).
系统发生基因组学支持多孔动物门(多孔动物门)的高级分类。
PLoS One. 2023 Dec 4;18(12):e0287281. doi: 10.1371/journal.pone.0287281. eCollection 2023.
4
Functional annotation and comparative analysis of four mitogenomes reported from Punjab, Pakistan.巴基斯坦旁遮普邦报道的四个线粒体基因组的功能注释与比较分析。
Saudi J Biol Sci. 2023 Apr;30(4):103605. doi: 10.1016/j.sjbs.2023.103605. Epub 2023 Feb 23.
5
Rickettsial DNA and a trans-splicing rRNA group I intron in the unorthodox mitogenome of the fern Haplopteris ensiformis.在蕨类植物 Haplopteris ensiformis 的非典型线粒体基因组中存在立克次体 DNA 和转剪接 rRNA 组 I 内含子。
Commun Biol. 2023 Mar 20;6(1):296. doi: 10.1038/s42003-023-04659-8.
6
Single-Cell Genomics Reveals the Divergent Mitochondrial Genomes of Retaria (Foraminifera and Radiolaria).单细胞基因组学揭示了有孔虫目(有孔虫和放射虫)不同的线粒体基因组。
mBio. 2023 Apr 25;14(2):e0030223. doi: 10.1128/mbio.00302-23. Epub 2023 Mar 20.
7
Confirmation of the first intronic sequence in the bivalvian mitochondrial genome of (Linnaeus, 1758).确认双壳类软体动物线粒体基因组中的第一个内含子序列。(Linnaeus,1758)。
Biol Lett. 2022 Oct;18(10):20220275. doi: 10.1098/rsbl.2022.0275. Epub 2022 Oct 5.
8
De Novo Long-Read Whole-Genome Assemblies and the Comparative Pan-Genome Analysis of Ascochyta Blight Pathogens Affecting Field Pea.影响豌豆的壳二孢叶枯病菌的从头长读全基因组组装及比较泛基因组分析
J Fungi (Basel). 2022 Aug 22;8(8):884. doi: 10.3390/jof8080884.
9
Unprecedented frequency of mitochondrial introns in colonial bilaterians.后生动物线粒体内含子的空前频率。
Sci Rep. 2022 Jun 28;12(1):10889. doi: 10.1038/s41598-022-14477-3.
10
Organellar Introns in Fungi, Algae, and Plants.细胞器基因在真菌、藻类和植物中的分布。
Cells. 2021 Aug 6;10(8):2001. doi: 10.3390/cells10082001.