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EuPathDB:真核病原体数据库门户。

EuPathDB: a portal to eukaryotic pathogen databases.

机构信息

Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D415-9. doi: 10.1093/nar/gkp941. Epub 2009 Nov 13.

DOI:10.1093/nar/gkp941
PMID:19914931
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2808945/
Abstract

EuPathDB (http://EuPathDB.org; formerly ApiDB) is an integrated database covering the eukaryotic pathogens of the genera Cryptosporidium, Giardia, Leishmania, Neospora, Plasmodium, Toxoplasma, Trichomonas and Trypanosoma. While each of these groups is supported by a taxon-specific database built upon the same infrastructure, the EuPathDB portal offers an entry point to all these resources, and the opportunity to leverage orthology for searches across genera. The most recent release of EuPathDB includes updates and changes affecting data content, infrastructure and the user interface, improving data access and enhancing the user experience. EuPathDB currently supports more than 80 searches and the recently-implemented 'search strategy' system enables users to construct complex multi-step searches via a graphical interface. Search results are dynamically displayed as the strategy is constructed or modified, and can be downloaded, saved, revised, or shared with other database users.

摘要

EuPathDB(http://EuPathDB.org;以前称为 ApiDB)是一个综合性数据库,涵盖了隐孢子虫、贾第鞭毛虫、利什曼原虫、新孢子虫、疟原虫、刚地弓形虫、滴虫和锥虫等属的真核病原体。虽然这些群组中的每一个都由基于相同基础设施构建的分类群特异性数据库提供支持,但 EuPathDB 门户提供了访问所有这些资源的入口点,并且有机会利用同源性进行属间搜索。EuPathDB 的最新版本包括影响数据内容、基础设施和用户界面的更新和更改,从而改善了数据访问并增强了用户体验。EuPathDB 目前支持超过 80 种搜索,最近实施的“搜索策略”系统使用户能够通过图形界面构建复杂的多步骤搜索。在构建或修改策略时,搜索结果会动态显示,并且可以下载、保存、修改或与其他数据库用户共享。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f66a/2808945/263c9ecdb23c/gkp941f1.jpg
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