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在高通量重测序的微阵列富集人类基因组位点中发现多态性

Polymorphism discovery in high-throughput resequenced microarray-enriched human genomic loci.

作者信息

Antipova Alena A, Sokolsky Tanya D, Clouser Christopher R, Dimalanta Eileen T, Hendrickson Cynthia L, Kosnopo Cisilya, Lee Clarence C, Ranade Swati S, Zhang Lei, Blanchard Alan P, McKernan Kevin J

机构信息

ABI, Beverly, Massachusetts 01915, USA.

出版信息

J Biomol Tech. 2009 Dec;20(5):253-7.

Abstract

Identifying genetic variants and mutations that underlie human diseases requires development of robust, cost-effective tools for routine resequencing of regions of interest in the human genome. Here, we demonstrate that coupling Applied Biosystems SOLiD system-sequencing platform with microarray capture of targeted regions provides an efficient and robust method for high-coverage resequencing and polymorphism discovery in human protein-coding exons.

摘要

识别构成人类疾病基础的基因变异和突变,需要开发强大且经济高效的工具,用于对人类基因组中感兴趣区域进行常规重测序。在此,我们证明,将应用生物系统公司的SOLiD系统测序平台与靶向区域的微阵列捕获相结合,为人类蛋白质编码外显子的高覆盖度重测序和多态性发现提供了一种高效且强大的方法。

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Nat Rev Genet. 2011 May;12(5):363-76. doi: 10.1038/nrg2958. Epub 2011 Mar 1.

本文引用的文献

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Nat Methods. 2007 Nov;4(11):931-6. doi: 10.1038/nmeth1110. Epub 2007 Oct 14.
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