• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

仅使用异核 NMR 实验来获取蛋白质的结构和动态信息。

Exclusively heteronuclear NMR experiments to obtain structural and dynamic information on proteins.

机构信息

Bruker BioSpin GmbH, Silberstreifen, 76287 Rheinstetten, Germany.

出版信息

Chemphyschem. 2010 Feb 22;11(3):689-95. doi: 10.1002/cphc.200900772.

DOI:10.1002/cphc.200900772
PMID:20077554
Abstract

Provided that (13)C-detected NMR experiments are either preferable or complementary to (1)H detection, we report here tools to determine C(alpha)-C', C'-N, and C(alpha)-H(alpha) residual dipolar couplings on the basis of the CON experiment. The coupling constants determined on ubiquitin are consistent with the subset measured with the (1)H-detected HNCO sequences. Since the utilization of residual dipolar couplings may depend on the mobility of the involved nuclei, we also provide tools to measure longitudinal and transverse relaxation rates of N and C'. This new set of experiments is a further development of a whole strategy based on (13)C direct-detection NMR spectroscopy for the study of biological macromolecules.

摘要

只要 (13)C 检测 NMR 实验优于或补充 (1)H 检测,我们就在这里报告工具,以便根据 CON 实验确定 C(alpha)-C'、C'-N 和 C(alpha)-H(alpha)的残余偶极耦合。在泛素上确定的耦合常数与用 (1)H 检测 HNCO 序列测量的子集一致。由于残余偶极耦合的利用可能取决于涉及核的流动性,我们还提供了用于测量 N 和 C'的纵向和横向弛豫率的工具。这组新的实验是基于 (13)C 直接检测 NMR 光谱学研究生物大分子的整体策略的进一步发展。

相似文献

1
Exclusively heteronuclear NMR experiments to obtain structural and dynamic information on proteins.仅使用异核 NMR 实验来获取蛋白质的结构和动态信息。
Chemphyschem. 2010 Feb 22;11(3):689-95. doi: 10.1002/cphc.200900772.
2
How much backbone motion in ubiquitin is required to account for dipolar coupling data measured in multiple alignment media as assessed by independent cross-validation?通过独立交叉验证评估,在多种比对介质中测量偶极耦合数据时,泛素需要多少骨架运动来解释这些数据?
J Am Chem Soc. 2004 Mar 10;126(9):2923-38. doi: 10.1021/ja0386804.
3
Self-consistency analysis of dipolar couplings in multiple alignments of ubiquitin.泛素多重比对中偶极耦合的自一致性分析
J Am Chem Soc. 2003 May 14;125(19):5596-7. doi: 10.1021/ja029719s.
4
Residual dipolar couplings as a tool to study molecular recognition of ubiquitin.剩余偶极耦合作为研究泛素分子识别的工具。
Biochem Soc Trans. 2008 Dec;36(Pt 6):1433-7. doi: 10.1042/BST0361433.
5
Conformational flexibility of a microcrystalline globular protein: order parameters by solid-state NMR spectroscopy.微晶球状蛋白质的构象灵活性:通过固态核磁共振光谱法测定序参数
J Am Chem Soc. 2006 Sep 6;128(35):11505-12. doi: 10.1021/ja062443u.
6
Insights into the mobility of methyl-bearing side chains in proteins from (3)J(CC) and (3)J(CN) couplings.通过(3)J(CC)和(3)J(CN)耦合对蛋白质中含甲基侧链流动性的洞察。
J Am Chem Soc. 2003 Jul 23;125(29):8959-66. doi: 10.1021/ja029972s.
7
Speeding up (13)C direct detection biomolecular NMR spectroscopy.加速 (13)C 直接检测生物分子 NMR 光谱学。
J Am Chem Soc. 2009 Oct 28;131(42):15339-45. doi: 10.1021/ja9058525.
8
Evaluation of backbone proton positions and dynamics in a small protein by liquid crystal NMR spectroscopy.通过液晶核磁共振光谱法评估小蛋白质中主链质子的位置和动力学。
J Am Chem Soc. 2003 Jul 30;125(30):9179-91. doi: 10.1021/ja0350684.
9
Simultaneous measurement of protein one-bond residual dipolar couplings without increased resonance overlap.在不增加共振重叠的情况下同时测量蛋白质一键残余偶极耦合。
J Magn Reson. 2005 Jun;174(2):245-53. doi: 10.1016/j.jmr.2005.02.010.
10
Determination of methyl 13C-15N dipolar couplings in peptides and proteins by three-dimensional and four-dimensional magic-angle spinning solid-state NMR spectroscopy.通过三维和四维魔角旋转固态核磁共振光谱法测定肽和蛋白质中的甲基13C-15N偶极耦合。
J Chem Phys. 2008 Feb 7;128(5):052314. doi: 10.1063/1.2817638.

引用本文的文献

1
Wnt signalosome assembly is governed by conformational flexibility of Axin and by the AP2 clathrin adaptor.Wnt信号小体的组装受Axin的构象灵活性和AP2网格蛋白衔接蛋白的调控。
Nat Commun. 2025 May 21;16(1):4718. doi: 10.1038/s41467-025-59984-9.
2
Cdk1 and PP2A constitute a molecular switch controlling orderly degradation of atypical E2Fs.细胞周期蛋白依赖性激酶1(Cdk1)和蛋白磷酸酶2A(PP2A)构成了一个分子开关,控制非典型E2F蛋白的有序降解。
bioRxiv. 2025 Feb 23:2025.02.23.639703. doi: 10.1101/2025.02.23.639703.
3
C Direct Detected NMR for Challenging Systems.
C 直接检测 NMR 用于具有挑战性的体系。
Chem Rev. 2022 May 25;122(10):9468-9496. doi: 10.1021/acs.chemrev.1c00871. Epub 2022 Jan 13.
4
Solution Ensemble of the C-Terminal Domain from the Transcription Factor Pdx1 Resembles an Excluded Volume Polymer.转录因子 Pdx1 的 C 末端结构域的溶液集合类似于排除体积聚合物。
J Phys Chem B. 2019 Jan 10;123(1):106-116. doi: 10.1021/acs.jpcb.8b10051. Epub 2018 Dec 24.
5
N detection harnesses the slow relaxation property of nitrogen: Delivering enhanced resolution for intrinsically disordered proteins.N 检测利用了氮气的缓慢弛豫特性:为天然无序蛋白提供了增强的分辨率。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Feb 20;115(8):E1710-E1719. doi: 10.1073/pnas.1717560115. Epub 2018 Feb 5.
6
A J-modulated protonless NMR experiment characterizes the conformational ensemble of the intrinsically disordered protein WIP.一种J调制无质子核磁共振实验表征了内在无序蛋白WIP的构象集合。
J Biomol NMR. 2016 Dec;66(4):243-257. doi: 10.1007/s10858-016-0073-6. Epub 2016 Nov 14.
7
Direct ¹³C-detected NMR experiments for mapping and characterization of hydrogen bonds in RNA.用于绘制和表征RNA中氢键的直接¹³C检测核磁共振实验。
J Biomol NMR. 2016 Mar;64(3):207-21. doi: 10.1007/s10858-016-0021-5. Epub 2016 Feb 6.
8
In-cell ¹³C NMR spectroscopy for the study of intrinsically disordered proteins.利用细胞内 ¹³C NMR 光谱研究天然无序蛋白质。
Nat Protoc. 2014 Sep;9(9):2005-16. doi: 10.1038/nprot.2014.124. Epub 2014 Jul 31.
9
SedNMR: a web tool for optimizing sedimentation of macromolecular solutes for SSNMR.SedNMR:用于 SSNMR 优化大分子溶质的沉淀的网络工具。
J Biomol NMR. 2013 Dec;57(4):319-26. doi: 10.1007/s10858-013-9795-x. Epub 2013 Nov 17.
10
Structural characterization of intrinsically disordered proteins by NMR spectroscopy.利用 NMR 光谱学对无规卷曲蛋白质进行结构特征分析。
Molecules. 2013 Sep 4;18(9):10802-28. doi: 10.3390/molecules180910802.