• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Computational docking of biomolecular complexes with AutoDock.

作者信息

Goodsell David S

出版信息

Cold Spring Harb Protoc. 2009 May;2009(5):pdb.prot5200. doi: 10.1101/pdb.prot5200.

DOI:10.1101/pdb.prot5200
PMID:20147154
Abstract
摘要

相似文献

1
Computational docking of biomolecular complexes with AutoDock.使用AutoDock对生物分子复合物进行计算对接。
Cold Spring Harb Protoc. 2009 May;2009(5):pdb.prot5200. doi: 10.1101/pdb.prot5200.
2
Using AutoDock for ligand-receptor docking.使用AutoDock进行配体-受体对接。
Curr Protoc Bioinformatics. 2008 Dec;Chapter 8:Unit 8.14. doi: 10.1002/0471250953.bi0814s24.
3
BDT: an easy-to-use front-end application for automation of massive docking tasks and complex docking strategies with AutoDock.BDT:一款易于使用的前端应用程序,用于通过AutoDock实现大规模对接任务和复杂对接策略的自动化。
Bioinformatics. 2006 Jul 15;22(14):1803-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btl197. Epub 2006 May 23.
4
Mapping drug-target interaction networks.绘制药物-靶点相互作用网络。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2009;2009:2336-9. doi: 10.1109/IEMBS.2009.5335053.
5
Virtual screening for HIV protease inhibitors: a comparison of AutoDock 4 and Vina.基于 AutoDock 4 和 Vina 的 HIV 蛋白酶抑制剂虚拟筛选比较。
PLoS One. 2010 Aug 4;5(8):e11955. doi: 10.1371/journal.pone.0011955.
6
Classification of protein complexes based on docking difficulty.基于对接难度的蛋白质复合物分类。
Proteins. 2005 Aug 1;60(2):176-80. doi: 10.1002/prot.20554.
7
Distributed automated docking of flexible ligands to proteins: parallel applications of AutoDock 2.4.柔性配体与蛋白质的分布式自动对接:AutoDock 2.4的并行应用
J Comput Aided Mol Des. 1996 Aug;10(4):293-304. doi: 10.1007/BF00124499.
8
Biskit--a software platform for structural bioinformatics.Biskit——一个用于结构生物信息学的软件平台。
Bioinformatics. 2007 Mar 15;23(6):769-70. doi: 10.1093/bioinformatics/btl655. Epub 2007 Jan 18.
9
ATTRACT and PTools: open source programs for protein-protein docking.ATTRACT和PTools:用于蛋白质-蛋白质对接的开源程序。
Methods Mol Biol. 2012;819:221-32. doi: 10.1007/978-1-61779-465-0_15.
10
JNets: exploring networks by integrating annotation.JNets:通过整合注释来探索网络。
BMC Bioinformatics. 2009 Mar 26;10:95. doi: 10.1186/1471-2105-10-95.

引用本文的文献

1
Overcoming Resistance in Cancer Therapy: Computational Exploration of PIK3CA Mutations, Unveiling Novel Non-Toxic Inhibitors, and Molecular Insights Into Targeting PI3Kα.克服癌症治疗中的耐药性:PIK3CA突变的计算探索、新型无毒抑制剂的发现以及靶向PI3Kα的分子见解
Bioinform Biol Insights. 2024 Aug 19;18:11779322241269386. doi: 10.1177/11779322241269386. eCollection 2024.
2
Synthesis and Evaluation of Amide and Thiourea Derivatives as Carbonic Anhydrase (CA) Inhibitors.作为碳酸酐酶(CA)抑制剂的酰胺和硫脲衍生物的合成与评价
ACS Omega. 2022 Dec 6;7(50):47251-47264. doi: 10.1021/acsomega.2c06513. eCollection 2022 Dec 20.
3
Antiviral potential of diminazene aceturate against SARS-CoV-2 proteases using computational and in vitro approaches.
使用计算和体外方法评估乙酰对氨基苯脒抗 SARS-CoV-2 蛋白酶的潜力。
Chem Biol Interact. 2022 Nov 1;367:110161. doi: 10.1016/j.cbi.2022.110161. Epub 2022 Sep 15.
4
Novel Isoxazole Derivative Attenuates Ethanol-Induced Gastric Mucosal Injury through Inhibition of H/K-ATPase Pump, Oxidative Stress and Inflammatory Pathways.新型异噁唑衍生物通过抑制 H/K-ATP 酶泵、氧化应激和炎症通路减轻乙醇诱导的胃黏膜损伤。
Molecules. 2022 Aug 9;27(16):5065. doi: 10.3390/molecules27165065.
5
Molecular Docking and Interaction Studies of Identified Abscisic Acid Receptors in An Perspective on Comprehending Stress Tolerance Mechanisms.从理解胁迫耐受机制的角度对已鉴定的脱落酸受体进行分子对接和相互作用研究
Curr Genomics. 2021 Dec 31;22(8):607-619. doi: 10.2174/1389202923666211222161006.
6
Computational Study on Temperature Driven Structure-Function Relationship of Polysaccharide Producing Bacterial Glycosyl Transferase Enzyme.温度驱动的产多糖细菌糖基转移酶结构-功能关系的计算研究
Polymers (Basel). 2021 May 28;13(11):1771. doi: 10.3390/polym13111771.
7
Biophysical Insight into the Interaction of Human Lysozyme with Anticancer Drug Anastrozole: A Multitechnique Approach.生物物理角度洞察人溶菌酶与抗癌药物阿那曲唑的相互作用:一种多技术方法。
ScientificWorldJournal. 2020 Aug 25;2020:8363685. doi: 10.1155/2020/8363685. eCollection 2020.
8
Targeting SARS-COV-2 non-structural protein 16: a virtual drug repurposing study.靶向 SARS-CoV-2 非结构蛋白 16:一项虚拟药物再利用研究。
J Biomol Struct Dyn. 2021 Aug;39(13):4633-4646. doi: 10.1080/07391102.2020.1779133. Epub 2020 Jun 23.
9
In Vivo, Proteomic, and In Silico Investigation of Sapodilla for Therapeutic Potential in Gastrointestinal Disorders.体内、蛋白质组学和计算研究在胃肠道疾病治疗潜力中的人心果。
Biomed Res Int. 2019 Dec 10;2019:4921086. doi: 10.1155/2019/4921086. eCollection 2019.
10
Apigenin Attenuates Atherogenesis through Inducing Macrophage Apoptosis via Inhibition of AKT Ser473 Phosphorylation and Downregulation of Plasminogen Activator Inhibitor-2.芹菜素通过抑制AKT Ser473磷酸化和下调纤溶酶原激活物抑制剂-2诱导巨噬细胞凋亡来减轻动脉粥样硬化的发生。
Oxid Med Cell Longev. 2015;2015:379538. doi: 10.1155/2015/379538. Epub 2015 Apr 15.