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比较基因组学和进化分析研究外源性化合物代谢芳基胺 N-乙酰基转移酶酶家族。

Comparative genomic and phylogenetic investigation of the xenobiotic metabolizing arylamine N-acetyltransferase enzyme family.

机构信息

Russell Research Center, Agricultural Research Service, United States Department of Agriculture, Athens, GA 30605, USA.

出版信息

FEBS Lett. 2010 Jul 16;584(14):3158-64. doi: 10.1016/j.febslet.2010.05.063. Epub 2010 Jun 2.

Abstract

Arylamine N-acetyltransferases (NATs) are xenobiotic metabolizing enzymes characterized in several bacteria and eukaryotic organisms. We report a comprehensive phylogenetic analysis employing an exhaustive dataset of NAT-homologous sequences recovered through inspection of 2445 genomes. We describe the first NAT homologues in viruses, archaea, protists, many fungi and invertebrates, providing complete annotations in line with the consensus nomenclature. Contrary to the NAT genes of vertebrates, introns are commonly found within the homologous coding regions of lower eukaryotes. The NATs of fungi and higher animals are distinctly monophyletic, but evidence supports a mixed phylogeny of NATs among bacteria, protists and possibly some invertebrates.

摘要

芳香胺 N-乙酰基转移酶(NATs)是一类异源生物代谢酶,在多种细菌和真核生物中都有特征。我们通过对 2445 个基因组的检查,利用一个详尽的 NAT 同源序列数据集进行了全面的系统发育分析。我们描述了病毒、古菌、原生生物、许多真菌和无脊椎动物中的首个 NAT 同源物,为其提供了符合共识命名法的完整注释。与脊椎动物的 NAT 基因不同,内含子通常存在于较低等真核生物的同源编码区中。真菌和高等动物的 NATs 明显是单系的,但有证据表明细菌、原生生物和可能的一些无脊椎动物的 NATs 存在混合系统发育。

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