Suppr超能文献

加权路径集合。

The reweighted path ensemble.

机构信息

Interdisciplinary Centre for Advanced Materials Simulation, Ruhr University Bochum, 44780 Bochum, Germany.

出版信息

J Chem Phys. 2010 Nov 7;133(17):174109. doi: 10.1063/1.3491817.

Abstract

We introduce a reweighting scheme for the path ensembles in the transition interface sampling framework. The reweighting allows for the analysis of free energy landscapes and committor projections in any collective variable space. We illustrate the reweighting scheme on a two dimensional potential with a nonlinear reaction coordinate and on a more realistic simulation of the Trp-cage folding process. We suggest that the reweighted path ensemble can be used to optimize possible nonlinear reaction coordinates.

摘要

我们引入了一种在跃迁界面采样框架中路径集合的重新加权方案。这种重新加权方法允许在任何集体变量空间中分析自由能景观和配分函数投影。我们在一个具有非线性反应坐标的二维势模型和更真实的 Trp-cage 折叠过程模拟上展示了这种重新加权方案。我们建议可以使用重新加权的路径集合来优化可能的非线性反应坐标。

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验