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迈向生物数据库核心:生物数据库的社区定义信息规范

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases.

作者信息

Gaudet Pascale, Bairoch Amos, Field Dawn, Sansone Susanna-Assunta, Taylor Chris, Attwood Teresa K, Bateman Alex, Blake Judith A, Bult Carol J, Cherry J Michael, Chisholm Rex L, Cochrane Guy, Cook Charles E, Eppig Janan T, Galperin Michael Y, Gentleman Robert, Goble Carole A, Gojobori Takashi, Hancock John M, Howe Douglas G, Imanishi Tadashi, Kelso Janet, Landsman David, Lewis Suzanna E, Mizrachi Ilene Karsch, Orchard Sandra, Ouellette B F Francis, Ranganathan Shoba, Richardson Lorna, Rocca-Serra Philippe, Schofield Paul N, Smedley Damian, Southan Christopher, Tan Tin Wee, Tatusova Tatiana, Whetzel Patricia L, White Owen, Yamasaki Chisato

出版信息

Nucleic Acids Res. 2011 Jan;39(Database issue):D7-10. doi: 10.1093/nar/gkq1173. Epub 2010 Nov 18.

DOI:10.1093/nar/gkq1173
PMID:21097465
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3013734/
Abstract

The present article proposes the adoption of a community-defined, uniform, generic description of the core attributes of biological databases, BioDBCore. The goals of these attributes are to provide a general overview of the database landscape, to encourage consistency and interoperability between resources and to promote the use of semantic and syntactic standards. BioDBCore will make it easier for users to evaluate the scope and relevance of available resources. This new resource will increase the collective impact of the information present in biological databases.

摘要

本文提议采用一种由社区定义的、统一的、通用的生物数据库核心属性描述,即生物数据库核心(BioDBCore)。这些属性的目标是提供数据库全景的总体概述,鼓励资源之间的一致性和互操作性,并促进语义和句法标准的使用。生物数据库核心将使用户更容易评估现有资源的范围和相关性。这一新资源将增强生物数据库中信息的总体影响力。

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